44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1035 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 380 aa  785    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  52.25 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  40.73 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  39.04 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  39.04 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  35.82 
 
 		 779 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  29.26 
 
 		 339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  27.75 
 
 		 331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  28.03 
 
 		 330 aa  113  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  27.09 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.59 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.59 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  30.52 
 
 		 249 aa  93.2  6e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  27.42 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  26.38 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  24.7 
 
 		 288 aa  67  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  23.92 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  24.73 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0707  putative phosphomevalonate kinase  28.18 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  26.56 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  32.18 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  27.87 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  26.97 
 
 		 289 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  22.98 
 
 		 336 aa  53.5  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  26.7 
 
 		 317 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  27.27 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.42 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  21.76 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  26.44 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  24.49 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  23.94 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  23.23 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  28.4 
 
 		 289 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.14 
 
 		 340 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  28.82 
 
 		 316 aa  49.7  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  23.94 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02311  phosphomevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_5G10680)  20.75 
 
 		 480 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000089901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  23.85 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  23.36 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  21.83 
 
 		 310 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  22.03 
 
 		 327 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  22.13 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  23.93 
 
 		 310 aa  44.3  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.95 
 
 		 295 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>