116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1033 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  100 
 
 		 322 aa  659    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  34.19 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  35.97 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  33.11 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  35.43 
 
 		 292 aa  152  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  31.79 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  35.2 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  32.89 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  32.89 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  34.91 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  30.24 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  32.55 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  26.67 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.37 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  29.52 
 
 		 400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  26.91 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.76 
 
 		 317 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.41 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25.71 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  28.66 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  28.11 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  29.04 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.24 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.14 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.8 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.82 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  30.68 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  26.69 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  28.43 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  26.98 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.03 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  25.5 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.6 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  26.16 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  25.52 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  24.13 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  24.13 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  23.59 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  32.24 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  24.83 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  39.24 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  27.11 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  25.93 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  22.98 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  25.76 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  23.7 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.37 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  23.27 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  23.3 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  24.38 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.27 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  34.34 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  24.87 
 
 		 735 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  20 
 
 		 361 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.51 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  21.98 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  23.9 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  23.16 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  24.43 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  21.39 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  28.21 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  25.84 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  24.22 
 
 		 382 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  28.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  22.56 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  22.26 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  22.89 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.67 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  24.29 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04600  mevalonate kinase  21.83 
 
 		 312 aa  49.7  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.797407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1391  homoserine kinase  23.19 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00775199  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1418  homoserine kinase  23.19 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.011674  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  24.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  24.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  24.41 
 
 		 379 aa  49.7  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  24.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  24.29 
 
 		 382 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  22.08 
 
 		 391 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  20.88 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  23.13 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  24.78 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  23.08 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  23.12 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  23.56 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  24.76 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  24.58 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  25.84 
 
 		 900 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  22.75 
 
 		 384 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3255  pantothenate kinase  27.57 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.343417 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  25.79 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  26.45 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  22.46 
 
 		 383 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  28.95 
 
 		 524 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  25.15 
 
 		 386 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>