159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82625 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  100 
 
 
518 aa  1064    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  39.56 
 
 
524 aa  326  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00610  galactokinase, putative  29.09 
 
 
532 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.707982  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  31.95 
 
 
488 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04330  galactokinase, putative  28.46 
 
 
560 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0351932  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  30.7 
 
 
387 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  33.07 
 
 
398 aa  97.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  30.95 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  31.58 
 
 
388 aa  94  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  27.95 
 
 
384 aa  93.6  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.47 
 
 
405 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  32.35 
 
 
386 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  24.84 
 
 
392 aa  89.7  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  29.12 
 
 
376 aa  87.8  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  32.68 
 
 
385 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  25.71 
 
 
420 aa  86.7  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  32.43 
 
 
387 aa  86.7  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  30.8 
 
 
372 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  30.88 
 
 
387 aa  86.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  31.82 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  31.47 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  34.46 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  30.8 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  32.43 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  33.17 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  29.91 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  30.58 
 
 
395 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  24.42 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  28.65 
 
 
388 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  34.33 
 
 
392 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  28.47 
 
 
373 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  30.92 
 
 
380 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  35.14 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  28.57 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  31.72 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  31.49 
 
 
362 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  34.59 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  36.22 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  29.57 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  32.62 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  27.68 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  32.84 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  27.68 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  27.68 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  30.35 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  27.68 
 
 
381 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  31.53 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  29.84 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  35.39 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  26.15 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  29.86 
 
 
401 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  29.03 
 
 
400 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  31.05 
 
 
409 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  27.86 
 
 
376 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  30.12 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  26.75 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  34.17 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  26.37 
 
 
383 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  29.18 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  32.52 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  27.61 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  29.15 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  29.15 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  29.15 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  30.88 
 
 
381 aa  77  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  32.55 
 
 
389 aa  77  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  26.14 
 
 
382 aa  77  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  26.49 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  31.86 
 
 
381 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  29.71 
 
 
350 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25.6 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  29.71 
 
 
350 aa  76.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  29.9 
 
 
385 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  29.41 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4682  galactokinase  32.06 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  25.6 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25.6 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  32.49 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25.6 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  28.2 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  31.03 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  28.89 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  28.09 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  25.44 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  26.35 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  25.99 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  30.41 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  32.28 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  25.3 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  29.71 
 
 
384 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  28.92 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  31.86 
 
 
381 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  29.01 
 
 
389 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  28.72 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  31.05 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>