190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1411 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  100 
 
 
383 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  81.98 
 
 
383 aa  641    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  100 
 
 
383 aa  791    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  100 
 
 
383 aa  791    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  72.58 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  72.58 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  72.58 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  72.58 
 
 
382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  72.58 
 
 
382 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  72.32 
 
 
382 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  72.06 
 
 
382 aa  571  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  72.44 
 
 
383 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  71.8 
 
 
382 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  71.54 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  71.54 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  71.8 
 
 
382 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  71.54 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  71.28 
 
 
382 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  549  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  64.4 
 
 
387 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  63.68 
 
 
405 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  63.16 
 
 
386 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  63.42 
 
 
386 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  60.22 
 
 
389 aa  475  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  60.16 
 
 
385 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  61.05 
 
 
387 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  61.05 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  59.16 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  55.95 
 
 
379 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  50.53 
 
 
388 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  51.62 
 
 
409 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  51.62 
 
 
385 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  49.73 
 
 
388 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  49.35 
 
 
393 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  48.28 
 
 
385 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  50 
 
 
394 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  47.61 
 
 
388 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  48.25 
 
 
384 aa  358  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  49.2 
 
 
391 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  47.61 
 
 
391 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  45.53 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  43.5 
 
 
381 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  43.5 
 
 
381 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  43.5 
 
 
381 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  43.5 
 
 
381 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  42.18 
 
 
381 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  42.44 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  42.18 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  42.44 
 
 
381 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  41.91 
 
 
381 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  45.92 
 
 
404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.22 
 
 
382 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  44.41 
 
 
403 aa  300  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  41.33 
 
 
398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  40.67 
 
 
387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  41.27 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.73 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.12 
 
 
385 aa  282  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  42.94 
 
 
349 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  41.64 
 
 
389 aa  279  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  42.37 
 
 
392 aa  279  7e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  47.17 
 
 
380 aa  278  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.62 
 
 
381 aa  276  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  40.63 
 
 
380 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  43.24 
 
 
372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  40.53 
 
 
387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  40.26 
 
 
387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  38.48 
 
 
389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.8 
 
 
388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.44 
 
 
394 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  39.74 
 
 
392 aa  265  7e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  40.23 
 
 
359 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41 
 
 
414 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  47.06 
 
 
390 aa  262  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  43.51 
 
 
405 aa  259  8e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  41 
 
 
396 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  39.49 
 
 
395 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  41.11 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  41.48 
 
 
369 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.74 
 
 
376 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  35.99 
 
 
386 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  44.48 
 
 
348 aa  246  6.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.88 
 
 
356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  40.88 
 
 
349 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  38.71 
 
 
392 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  38.99 
 
 
357 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  39.39 
 
 
391 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  41.11 
 
 
401 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  38.32 
 
 
358 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  39.31 
 
 
355 aa  239  8e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.1 
 
 
390 aa  236  6e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.57 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.01 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.5 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  39.47 
 
 
388 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  37.99 
 
 
394 aa  232  8.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  37.93 
 
 
397 aa  232  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  40 
 
 
395 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  39.45 
 
 
418 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.36 
 
 
383 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>