185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3271 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  100 
 
 		 388 aa  800    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  81.7 
 
 		 388 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  80.93 
 
 		 388 aa  661    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  74.55 
 
 		 384 aa  600  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  67.71 
 
 		 381 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  67.71 
 
 		 381 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  67.71 
 
 		 381 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  67.71 
 
 		 381 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  66.67 
 
 		 381 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  66.67 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  66.15 
 
 		 381 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  65.89 
 
 		 381 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  65.36 
 
 		 381 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  63.64 
 
 		 382 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  58.59 
 
 		 381 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  60.05 
 
 		 380 aa  462  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  52.6 
 
 		 405 aa  411  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  50.78 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  51.05 
 
 		 386 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  51.32 
 
 		 386 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  49.34 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  49.47 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  49.21 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  49.34 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  50 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  49.6 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  49.34 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  49.21 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  49.34 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  51.87 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  49.73 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  49.21 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  50 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  48.81 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  49.07 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  50.53 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  50.53 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  50.53 
 
 		 383 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  50.68 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  49.61 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  51.48 
 
 		 383 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  48.44 
 
 		 385 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  49.74 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  52.24 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  51.85 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  50.26 
 
 		 383 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  47.66 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  48.15 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  49.59 
 
 		 409 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  49.32 
 
 		 385 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  44.44 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  42.82 
 
 		 391 aa  302  8.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.62 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  41.11 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  40.26 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  41.36 
 
 		 372 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.57 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  40.72 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  37.17 
 
 		 387 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  39.53 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  40.58 
 
 		 385 aa  265  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.35 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.87 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40.39 
 
 		 349 aa  259  7e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  39.12 
 
 		 392 aa  258  9e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.91 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.87 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.79 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  39.74 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  39.44 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.52 
 
 		 387 aa  248  9e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  40 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  38.12 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.28 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  37.79 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  39.78 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.79 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.9 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  40.84 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  40.6 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  35.23 
 
 		 399 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.64 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  40.42 
 
 		 357 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.53 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.7 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  37.14 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  35.08 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  38.28 
 
 		 390 aa  232  9e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.72 
 
 		 358 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.35 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  38.5 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  40.06 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  32.42 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.3 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  33.96 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.23 
 
 		 383 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  39.69 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.77 
 
 		 389 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  38.02 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>