204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0998 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  84.14 
 
 		 391 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  100 
 
 		 391 aa  790    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  60.37 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  50.13 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  47.61 
 
 		 403 aa  349  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  48.02 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  48.16 
 
 		 386 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  49.22 
 
 		 383 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  46.7 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  46.7 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  46.7 
 
 		 382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  46.7 
 
 		 382 aa  339  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  46.7 
 
 		 382 aa  339  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  46.44 
 
 		 382 aa  338  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  48 
 
 		 405 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  45.91 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  45.91 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  45.91 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  45.91 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  46.84 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  50.26 
 
 		 387 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  45.65 
 
 		 382 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  45.65 
 
 		 382 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  46.77 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  45.12 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  47.61 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  47.61 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  47.61 
 
 		 383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  50.26 
 
 		 383 aa  326  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  46.84 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  48.41 
 
 		 383 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  46.26 
 
 		 385 aa  322  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  43.57 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  43.47 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  44.47 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  42.78 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  48.35 
 
 		 376 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  41.88 
 
 		 385 aa  305  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  41.84 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  48.7 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  42.82 
 
 		 388 aa  302  9e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  40.93 
 
 		 387 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  42.89 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  46.61 
 
 		 349 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  43.01 
 
 		 389 aa  297  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  42.55 
 
 		 388 aa  296  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  46.81 
 
 		 387 aa  295  7e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  43.09 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  43.44 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  43.38 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  47.49 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  46.05 
 
 		 359 aa  291  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  39.69 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  42.82 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  42.02 
 
 		 388 aa  289  7e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  39.74 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.34 
 
 		 387 aa  283  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.08 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  38.86 
 
 		 388 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  41.1 
 
 		 388 aa  278  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  41.19 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.76 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  39.69 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  41.22 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  41.22 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  41.22 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  36.17 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  41.22 
 
 		 381 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  41.95 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  43.1 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  40.64 
 
 		 389 aa  266  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.93 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  38.32 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.44 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  38.7 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  43.53 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  41.25 
 
 		 392 aa  263  4e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  40.16 
 
 		 381 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  39.1 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  36.94 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  37.97 
 
 		 383 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  38.83 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  38.86 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  39.1 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  39.1 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  36.25 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  36.46 
 
 		 392 aa  253  5.000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  44.36 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  40.27 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.51 
 
 		 384 aa  248  9e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  42.17 
 
 		 357 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  39.06 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  38.16 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  39.52 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.5 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.5 
 
 		 350 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  41.31 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.34 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  43.54 
 
 		 348 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  37.5 
 
 		 381 aa  239  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>