185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0577 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  100 
 
 
384 aa  790    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  78.39 
 
 
388 aa  630  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  74.81 
 
 
388 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  74.55 
 
 
388 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  66.23 
 
 
381 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  66.23 
 
 
381 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  66.23 
 
 
381 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  66.23 
 
 
381 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  65.62 
 
 
381 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  65.45 
 
 
381 aa  524  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  65.1 
 
 
381 aa  518  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  64.58 
 
 
381 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  64.32 
 
 
381 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  63.12 
 
 
382 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  61.2 
 
 
380 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  57.51 
 
 
381 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  53.08 
 
 
405 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  50 
 
 
386 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  50.26 
 
 
385 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  49.33 
 
 
389 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  50.68 
 
 
386 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  50.66 
 
 
383 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  50.41 
 
 
387 aa  373  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  49.47 
 
 
382 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  49.2 
 
 
382 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  49.87 
 
 
382 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  49.6 
 
 
382 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  49.6 
 
 
382 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  49.2 
 
 
382 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  49.6 
 
 
382 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  49.2 
 
 
382 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  49.6 
 
 
382 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  49.2 
 
 
382 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  49.87 
 
 
387 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  48.66 
 
 
382 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  50.27 
 
 
383 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  49.07 
 
 
382 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  50.54 
 
 
409 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  48.81 
 
 
385 aa  363  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  49.07 
 
 
382 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  51.34 
 
 
387 aa  362  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  50.53 
 
 
383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  50.4 
 
 
387 aa  362  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  49.34 
 
 
379 aa  361  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  49.21 
 
 
385 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  48.43 
 
 
394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  48.25 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  48.25 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  48.25 
 
 
383 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  48.15 
 
 
393 aa  349  4e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  45.97 
 
 
412 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  41.49 
 
 
398 aa  299  7e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  41.95 
 
 
391 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  43.38 
 
 
391 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.32 
 
 
404 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.41 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  41.64 
 
 
403 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  41.03 
 
 
394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  40.53 
 
 
385 aa  269  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  41.51 
 
 
386 aa  264  2e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  38.98 
 
 
392 aa  263  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  37.13 
 
 
387 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  39.43 
 
 
387 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  39.69 
 
 
396 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  39.95 
 
 
389 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.22 
 
 
388 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  37.82 
 
 
389 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  37.89 
 
 
389 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.36 
 
 
399 aa  246  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  41.18 
 
 
380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  42.39 
 
 
349 aa  242  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  38.79 
 
 
386 aa  242  9e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.46 
 
 
405 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  36.29 
 
 
387 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.73 
 
 
385 aa  239  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  36.29 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  38.13 
 
 
391 aa  239  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.94 
 
 
356 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  40.88 
 
 
359 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36.77 
 
 
440 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  34.72 
 
 
351 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  42.47 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.38 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  36.77 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  35.34 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  35.86 
 
 
392 aa  232  7.000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  37.17 
 
 
383 aa  232  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  38.63 
 
 
376 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  36.39 
 
 
350 aa  230  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.2 
 
 
380 aa  230  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  36.39 
 
 
350 aa  230  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  37.78 
 
 
369 aa  228  9e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  38.95 
 
 
373 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  39.58 
 
 
349 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  35.93 
 
 
355 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  33.93 
 
 
395 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  34.78 
 
 
397 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  37.87 
 
 
401 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  39.23 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.26 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>