179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1633 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1633  galactokinase  100 
 
 
384 aa  789    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  47.14 
 
 
395 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  48.28 
 
 
388 aa  342  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  46.43 
 
 
389 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  43.62 
 
 
386 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  40.92 
 
 
404 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  39.77 
 
 
414 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  41.07 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  38.06 
 
 
398 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  36.94 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  40.38 
 
 
387 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  40.27 
 
 
355 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  42.11 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  42.11 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  37.74 
 
 
403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  37.34 
 
 
405 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  38.8 
 
 
385 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  36.51 
 
 
391 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  37.98 
 
 
389 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  38.86 
 
 
396 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  38.04 
 
 
394 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  36.1 
 
 
380 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.99 
 
 
388 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  36.22 
 
 
388 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  36.06 
 
 
387 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  36.06 
 
 
387 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  37.21 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  35.08 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  36.43 
 
 
392 aa  233  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  35.34 
 
 
384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  36.5 
 
 
372 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  37.2 
 
 
386 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.26 
 
 
351 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  35.03 
 
 
387 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  35.79 
 
 
392 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.62 
 
 
387 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  33.42 
 
 
388 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  36.36 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  34.02 
 
 
385 aa  223  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  34.37 
 
 
389 aa  222  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  34.38 
 
 
382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  34.38 
 
 
382 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  35.34 
 
 
389 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  34.38 
 
 
382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  34.11 
 
 
382 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  34.11 
 
 
382 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  33.25 
 
 
387 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  37.93 
 
 
396 aa  215  9e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  33.85 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  33.85 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  33.85 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  33.85 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  33.85 
 
 
382 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  33.59 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  33.59 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  33.07 
 
 
383 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  34.57 
 
 
383 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  38.38 
 
 
390 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  33.87 
 
 
386 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  34.14 
 
 
386 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  34.22 
 
 
405 aa  209  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.42 
 
 
399 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  34.55 
 
 
385 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  33.42 
 
 
387 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  35.06 
 
 
387 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  34.55 
 
 
383 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  32.29 
 
 
382 aa  203  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  31.93 
 
 
392 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  31.87 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  35.54 
 
 
376 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  35.69 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.25 
 
 
359 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  34.19 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  33.87 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  33.87 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  33.87 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  33.85 
 
 
387 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  34.82 
 
 
395 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  31.56 
 
 
409 aa  196  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  30.93 
 
 
385 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  31.88 
 
 
394 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  31.15 
 
 
381 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  31.15 
 
 
381 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  33.76 
 
 
401 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  31.15 
 
 
381 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  31.15 
 
 
381 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  32.28 
 
 
393 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  32.9 
 
 
384 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.02 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  30.95 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  34.08 
 
 
383 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  32.1 
 
 
394 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  33.25 
 
 
391 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  34.36 
 
 
400 aa  189  9e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  33.33 
 
 
358 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  34.85 
 
 
349 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  32.68 
 
 
418 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  36.44 
 
 
369 aa  185  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  30.26 
 
 
381 aa  183  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  30.1 
 
 
381 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>