200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0425 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  100 
 
 
351 aa  703    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  54.34 
 
 
350 aa  379  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  54.34 
 
 
350 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  52.33 
 
 
355 aa  358  8e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.19 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  41.44 
 
 
380 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  37.39 
 
 
372 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.04 
 
 
387 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  36.31 
 
 
403 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.18 
 
 
389 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  37.82 
 
 
382 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  36.31 
 
 
349 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  36.01 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  34.72 
 
 
384 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.36 
 
 
395 aa  242  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  36.13 
 
 
382 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  36.13 
 
 
382 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  36.13 
 
 
382 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  35.57 
 
 
382 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  36.24 
 
 
392 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  36.12 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  36.84 
 
 
386 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  36.24 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  35.93 
 
 
405 aa  237  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  33.79 
 
 
388 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.65 
 
 
389 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  33.89 
 
 
389 aa  236  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  39 
 
 
386 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  35.76 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  34.45 
 
 
409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  35.29 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  35.01 
 
 
382 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  38.64 
 
 
383 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  32.42 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  34.45 
 
 
385 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  38.46 
 
 
385 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  37.09 
 
 
387 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  36.67 
 
 
358 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  35.01 
 
 
382 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  35.81 
 
 
384 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  36.46 
 
 
391 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.15 
 
 
387 aa  229  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  35.28 
 
 
391 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.36 
 
 
359 aa  229  7e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  36.31 
 
 
383 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  38.82 
 
 
383 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  38.82 
 
 
383 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  37.68 
 
 
387 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  38.82 
 
 
383 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  34.25 
 
 
393 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  36.2 
 
 
356 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  36.2 
 
 
357 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  32.29 
 
 
414 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  34.65 
 
 
379 aa  225  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  38.89 
 
 
386 aa  225  7e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  34.54 
 
 
383 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  33.24 
 
 
388 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  36.57 
 
 
385 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.46 
 
 
412 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  39.16 
 
 
383 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  34.73 
 
 
385 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  37.2 
 
 
373 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  40.46 
 
 
351 aa  219  6e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.36 
 
 
399 aa  218  1e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  34.5 
 
 
397 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  35.75 
 
 
391 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  37.36 
 
 
385 aa  217  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  33.33 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  35.69 
 
 
389 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  34.29 
 
 
401 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  34.19 
 
 
395 aa  209  6e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  34.93 
 
 
392 aa  209  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  36.49 
 
 
390 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  36.06 
 
 
369 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  33.82 
 
 
361 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.5 
 
 
388 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  34.5 
 
 
392 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  34.42 
 
 
349 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.89 
 
 
387 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  34.59 
 
 
394 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.18 
 
 
387 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  31.88 
 
 
403 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  36.13 
 
 
387 aa  200  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  33.43 
 
 
387 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  35.71 
 
 
386 aa  199  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  35.67 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  32.87 
 
 
387 aa  197  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  37.39 
 
 
389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  32.33 
 
 
396 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  31.36 
 
 
392 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  30.47 
 
 
381 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  30.47 
 
 
381 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  30.47 
 
 
381 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  30.47 
 
 
381 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  36.56 
 
 
396 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>