180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1171 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  85.08 
 
 
383 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  100 
 
 
383 aa  783    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  70.79 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  70.79 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  70.53 
 
 
382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  70.79 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  70.79 
 
 
382 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  70.79 
 
 
382 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  70 
 
 
382 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  70 
 
 
382 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  70 
 
 
382 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  69.47 
 
 
382 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  69.74 
 
 
382 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  69.47 
 
 
382 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  69.47 
 
 
382 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  65.68 
 
 
405 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  64.08 
 
 
386 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  62.83 
 
 
387 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  62.99 
 
 
386 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  62.63 
 
 
385 aa  495  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  63.78 
 
 
387 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  63.59 
 
 
387 aa  481  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  60.7 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  62.73 
 
 
387 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  58.27 
 
 
379 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  53.25 
 
 
393 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  52.8 
 
 
409 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  52.41 
 
 
385 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  51.59 
 
 
388 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  50.65 
 
 
394 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  50.53 
 
 
384 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  49.47 
 
 
388 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  50.26 
 
 
388 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  49.87 
 
 
385 aa  364  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  52.38 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  50.52 
 
 
391 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  45.5 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  45.5 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  45.5 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  45.5 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  45.65 
 
 
412 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  43.65 
 
 
381 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  44.18 
 
 
381 aa  316  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  46.2 
 
 
404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  43.8 
 
 
382 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  43.92 
 
 
381 aa  311  9e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  44.74 
 
 
398 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  43.92 
 
 
381 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  43.65 
 
 
381 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  50.66 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  42.26 
 
 
387 aa  300  3e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  42.32 
 
 
387 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  42.74 
 
 
380 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  44.85 
 
 
403 aa  288  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  41.64 
 
 
385 aa  288  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  39.79 
 
 
386 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.28 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  44.44 
 
 
372 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  44.6 
 
 
349 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  40.26 
 
 
387 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.84 
 
 
387 aa  276  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  38.93 
 
 
389 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  40.26 
 
 
389 aa  275  8e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.83 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  41.26 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  47.63 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  39.11 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  39.53 
 
 
388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  43.1 
 
 
359 aa  272  9e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  40.05 
 
 
392 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  42.29 
 
 
392 aa  261  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  44.47 
 
 
405 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  43.35 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  44.14 
 
 
376 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  37.01 
 
 
386 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.89 
 
 
389 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.39 
 
 
414 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  37.57 
 
 
383 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  39.08 
 
 
397 aa  248  9e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.26 
 
 
390 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.06 
 
 
395 aa  245  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  40.62 
 
 
358 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.8 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  44.17 
 
 
348 aa  240  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  39.9 
 
 
394 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  33.85 
 
 
386 aa  239  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  42.86 
 
 
369 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  35.08 
 
 
392 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  40.45 
 
 
356 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  41.06 
 
 
418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  41.76 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.26 
 
 
373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  40.31 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  41.21 
 
 
401 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.33 
 
 
357 aa  233  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  37.92 
 
 
388 aa  232  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>