195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1191 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  100 
 
 
373 aa  726    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  69.35 
 
 
372 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  59.2 
 
 
376 aa  364  1e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  53.85 
 
 
389 aa  349  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  49.74 
 
 
385 aa  339  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  53.74 
 
 
379 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  50.39 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  48.27 
 
 
401 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  48.93 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  49.23 
 
 
399 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  47.53 
 
 
400 aa  290  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  45.43 
 
 
391 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  52.37 
 
 
409 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.15 
 
 
404 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  46 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  47.26 
 
 
403 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  47.61 
 
 
418 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  48.45 
 
 
407 aa  277  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  41.55 
 
 
386 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  41.53 
 
 
383 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  40.91 
 
 
386 aa  273  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  47.42 
 
 
429 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  39.43 
 
 
387 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  49.87 
 
 
409 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  40 
 
 
382 aa  268  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  42.45 
 
 
387 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  46.7 
 
 
420 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  41.6 
 
 
405 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  40 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  40 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  40 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  40 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.73 
 
 
382 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  43.85 
 
 
391 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  41.01 
 
 
385 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  43.24 
 
 
403 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  39.73 
 
 
382 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  42.56 
 
 
416 aa  263  4.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  38.4 
 
 
382 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  38.13 
 
 
382 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  38.13 
 
 
382 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  39.23 
 
 
379 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  46.48 
 
 
408 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  41.08 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  41.08 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  41.87 
 
 
383 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  38.13 
 
 
382 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.21 
 
 
388 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  38.13 
 
 
382 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  39.21 
 
 
388 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.91 
 
 
383 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.91 
 
 
383 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.91 
 
 
383 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  38.67 
 
 
382 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  44.07 
 
 
391 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  44.87 
 
 
398 aa  256  4e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  41.8 
 
 
383 aa  255  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  39.17 
 
 
387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  37.89 
 
 
388 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  37.24 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.11 
 
 
384 aa  252  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  41.8 
 
 
393 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.59 
 
 
351 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  39.26 
 
 
392 aa  246  4e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  42.53 
 
 
359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  38.17 
 
 
389 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.8 
 
 
355 aa  245  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  36.27 
 
 
389 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.08 
 
 
387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  40.29 
 
 
385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  42.78 
 
 
349 aa  240  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  37.8 
 
 
397 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.26 
 
 
380 aa  239  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  38.83 
 
 
385 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  37.7 
 
 
385 aa  238  9e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  36.62 
 
 
386 aa  238  1e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  39.04 
 
 
409 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  37.53 
 
 
383 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.79 
 
 
388 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.54 
 
 
387 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.05 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  36.31 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  35.28 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  38.34 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  37.7 
 
 
389 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  38.42 
 
 
381 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  38.42 
 
 
381 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  38.42 
 
 
381 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.99 
 
 
405 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  38.16 
 
 
381 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  43.09 
 
 
390 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.42 
 
 
387 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  35.15 
 
 
384 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  37.11 
 
 
381 aa  226  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  37.99 
 
 
387 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  38.12 
 
 
412 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  37.8 
 
 
389 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.16 
 
 
392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  41.36 
 
 
356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  36.58 
 
 
381 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>