167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3408 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0694  galactokinase  94.21 
 
 		 381 aa  747    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  100 
 
 		 381 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  98.95 
 
 		 381 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  98.16 
 
 		 381 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  88.16 
 
 		 381 aa  698    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  88.16 
 
 		 381 aa  698    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  90.79 
 
 		 381 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  87.89 
 
 		 381 aa  696    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  88.16 
 
 		 381 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  68.49 
 
 		 388 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  67.45 
 
 		 388 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  66.67 
 
 		 388 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  65.1 
 
 		 384 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  63.78 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  61.84 
 
 		 381 aa  501  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  62.27 
 
 		 380 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  43.38 
 
 		 405 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  44.05 
 
 		 387 aa  332  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  40.78 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  43.96 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  43.23 
 
 		 385 aa  319  5e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  42.63 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  40.78 
 
 		 386 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  41.25 
 
 		 385 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  42.37 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  42.37 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  42.37 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  42.37 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  42.37 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  42.3 
 
 		 382 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  43.5 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  41.84 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  42.04 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  42.04 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  42.04 
 
 		 382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  42.04 
 
 		 382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  43.04 
 
 		 382 aa  312  4.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  41.53 
 
 		 387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  43.92 
 
 		 383 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  40.75 
 
 		 389 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  42.44 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  43.01 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  42.44 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  42.44 
 
 		 383 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  42.22 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  40.26 
 
 		 394 aa  289  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  39.73 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  40.92 
 
 		 409 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  40.7 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  40 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  37.53 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.1 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.46 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  37.84 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  35.01 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  37.04 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  35.98 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  36.91 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  34.41 
 
 		 387 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  35.28 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  36.22 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.28 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.62 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  35.01 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  36.75 
 
 		 385 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  35.6 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  36.96 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  36.94 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  36.2 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  33.87 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  36.44 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  34.85 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  34.65 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  37.12 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  35.61 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  38.5 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  35.47 
 
 		 385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  35.06 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  32.72 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  37.78 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  32 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  35.59 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  34.02 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  31.79 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  33.07 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  34.58 
 
 		 395 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  35.59 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  32.72 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  33.92 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  31.89 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  31.95 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  34.71 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  34.38 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  33.42 
 
 		 388 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  34.38 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  34.1 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  31.66 
 
 		 383 aa  186  9e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  36.79 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  30.1 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.23 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>