175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4020 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  81.7 
 
 		 388 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  100 
 
 		 388 aa  799    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  83.76 
 
 		 388 aa  686    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  78.39 
 
 		 384 aa  630  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  68.49 
 
 		 381 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  68.49 
 
 		 381 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  67.97 
 
 		 381 aa  557  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  68.49 
 
 		 381 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  68.49 
 
 		 381 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  67.97 
 
 		 381 aa  550  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  67.45 
 
 		 381 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  67.45 
 
 		 381 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  67.19 
 
 		 381 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  63.9 
 
 		 382 aa  513  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  59.38 
 
 		 381 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  61.62 
 
 		 380 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  52.6 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  51.3 
 
 		 386 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  51.3 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  52.03 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  51.16 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  51.34 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  50.67 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  53.44 
 
 		 387 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  53.97 
 
 		 387 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  49.33 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  49.74 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  49.74 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  49.74 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  49.33 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  49.74 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  49.6 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  49.33 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  49.33 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  48.95 
 
 		 385 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  50 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  51.59 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  49.73 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  49.33 
 
 		 382 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  48.8 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  51.48 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  49.61 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  49.73 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  51.35 
 
 		 379 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  49.73 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  49.73 
 
 		 383 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  47.27 
 
 		 394 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  49.59 
 
 		 409 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  49.73 
 
 		 385 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  46.83 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  44.5 
 
 		 412 aa  327  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  42.55 
 
 		 391 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.78 
 
 		 404 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  41.53 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  41.64 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  41.8 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.26 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.99 
 
 		 372 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  38.86 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.63 
 
 		 385 aa  272  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.21 
 
 		 387 aa  269  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  40.86 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  38.89 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.32 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.58 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  41.69 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.66 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  41.19 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  37.05 
 
 		 386 aa  253  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  40.59 
 
 		 405 aa  252  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  36.83 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  39.22 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  40.34 
 
 		 349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  36.71 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.48 
 
 		 389 aa  242  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  37.88 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  41.53 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  38.39 
 
 		 440 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.14 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  36.22 
 
 		 384 aa  239  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.55 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  37.37 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  38.98 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  37.5 
 
 		 399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.85 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  38.1 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.47 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.62 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  38.8 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  37.11 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  33.79 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  34.75 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35 
 
 		 383 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  34.42 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  38.02 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  40 
 
 		 407 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  38.81 
 
 		 369 aa  223  4e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  36.29 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  36.29 
 
 		 350 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  37.38 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>