182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1291 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  81.98 
 
 
383 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  100 
 
 
383 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  81.98 
 
 
383 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  81.98 
 
 
383 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  74.67 
 
 
382 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  74.93 
 
 
382 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  73.89 
 
 
382 aa  587  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  589  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  74.15 
 
 
382 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  73.37 
 
 
382 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  73.89 
 
 
382 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  74.41 
 
 
382 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  74.41 
 
 
382 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  74.28 
 
 
383 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  72.7 
 
 
383 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  67.02 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  66.58 
 
 
386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  65.44 
 
 
387 aa  509  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  64.12 
 
 
405 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  63.1 
 
 
389 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  61.58 
 
 
385 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  62.63 
 
 
387 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  62.37 
 
 
387 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  59.63 
 
 
387 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  58.11 
 
 
379 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  54.32 
 
 
385 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  54.05 
 
 
409 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  51.53 
 
 
393 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  51.48 
 
 
388 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  51.07 
 
 
385 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  51.21 
 
 
388 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  51.43 
 
 
394 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  50.27 
 
 
384 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  48.79 
 
 
388 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  49.73 
 
 
391 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  48.41 
 
 
391 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  47.21 
 
 
412 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  44.09 
 
 
381 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  44.09 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  44.09 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  44.09 
 
 
381 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  43.01 
 
 
381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  43.01 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  42.74 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  44.12 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  43.01 
 
 
381 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  42.47 
 
 
381 aa  307  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  45.53 
 
 
404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  42.71 
 
 
398 aa  302  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  43.8 
 
 
403 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.95 
 
 
392 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  42.12 
 
 
387 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  42.06 
 
 
386 aa  287  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  45.01 
 
 
349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  42.97 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  42.25 
 
 
380 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  47.11 
 
 
380 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  49.34 
 
 
390 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  39.08 
 
 
381 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  41.8 
 
 
385 aa  276  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  40.21 
 
 
389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.21 
 
 
394 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  45.92 
 
 
372 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  42.21 
 
 
359 aa  270  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  38.9 
 
 
386 aa  268  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  39.59 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  38.9 
 
 
387 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.69 
 
 
389 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.64 
 
 
387 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  39.32 
 
 
392 aa  258  1e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.88 
 
 
396 aa  256  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  40.17 
 
 
414 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  38.27 
 
 
395 aa  252  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  43.3 
 
 
389 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  42.97 
 
 
405 aa  249  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  43.02 
 
 
376 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  41.51 
 
 
389 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  39.41 
 
 
383 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  41 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  40 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  41.67 
 
 
395 aa  239  5e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  39.47 
 
 
390 aa  238  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  41.72 
 
 
349 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.66 
 
 
391 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  42.21 
 
 
373 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  44.18 
 
 
348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  38.64 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.34 
 
 
394 aa  235  9e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  40.9 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  40.64 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  38.27 
 
 
397 aa  233  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  39.29 
 
 
358 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.04 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  38.77 
 
 
392 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.4 
 
 
357 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  35.42 
 
 
392 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>