175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3238 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  100 
 
 		 397 aa  812    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  55.1 
 
 		 389 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  53.52 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  46.08 
 
 		 388 aa  363  4e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  48.21 
 
 		 385 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  46.21 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  44.87 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  45.38 
 
 		 396 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  45.29 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  45.29 
 
 		 387 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  42.35 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  44.87 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  45.85 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  42.82 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  44 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  42.16 
 
 		 383 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.6 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  43.54 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  44.64 
 
 		 389 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  40.9 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  40.16 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  39.74 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  41.22 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  41.21 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.9 
 
 		 389 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.49 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  42.2 
 
 		 390 aa  280  3e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  43.83 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  41.07 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  41.98 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  38.4 
 
 		 395 aa  272  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  40.89 
 
 		 382 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  40.89 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  40.89 
 
 		 382 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  40.62 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  40 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  40.54 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  40.27 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  40.27 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  39.9 
 
 		 386 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  40.27 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  40.27 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  40.87 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  38.89 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  40 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.46 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  38.21 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  39.45 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  36.29 
 
 		 380 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  38.15 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  38.87 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  38.72 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  36.92 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  36.67 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  37.75 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  37.5 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  39.57 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  39.57 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.47 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  37.84 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  34.55 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  39.08 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.54 
 
 		 355 aa  229  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  38.54 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  36.7 
 
 		 387 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.21 
 
 		 387 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  34.75 
 
 		 388 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.08 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.17 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  34.78 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  38.27 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  39.78 
 
 		 376 aa  222  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  37.93 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  37.93 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  37.93 
 
 		 383 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  33.83 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  33.74 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  34.09 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  34.5 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.97 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  32.85 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.03 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  36.55 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  34.84 
 
 		 372 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  35.93 
 
 		 349 aa  212  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  39.84 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  37.95 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  33.33 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  36.41 
 
 		 392 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  33.92 
 
 		 407 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  33.83 
 
 		 416 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  36.39 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  34.15 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  36.15 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2677  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  33.01 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  33.08 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  32.98 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  35.07 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  34.69 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>