180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0536 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  78.41 
 
 
394 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  100 
 
 
396 aa  815    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  57.81 
 
 
385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  57.55 
 
 
388 aa  465  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  56.84 
 
 
386 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  53.91 
 
 
387 aa  422  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  51.81 
 
 
392 aa  409  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  51.04 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  51.04 
 
 
387 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  53.12 
 
 
388 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  51.3 
 
 
387 aa  389  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  49.74 
 
 
389 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  51.3 
 
 
390 aa  375  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  52.13 
 
 
389 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  47.79 
 
 
392 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  49.09 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  49.22 
 
 
399 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  47.55 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  46.22 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  47.81 
 
 
394 aa  333  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  45.38 
 
 
397 aa  330  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  45.85 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  42.78 
 
 
386 aa  317  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.67 
 
 
404 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  41.3 
 
 
399 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  40.31 
 
 
389 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  41.25 
 
 
398 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  39.69 
 
 
395 aa  278  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  41.94 
 
 
403 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  40.37 
 
 
391 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  40.99 
 
 
405 aa  273  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  40.76 
 
 
391 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  40.21 
 
 
386 aa  269  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  40.79 
 
 
386 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  40.32 
 
 
382 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  40.32 
 
 
382 aa  266  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  40.32 
 
 
382 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  40.32 
 
 
382 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  40.32 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.53 
 
 
382 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  39.61 
 
 
382 aa  266  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  40.79 
 
 
409 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  40.05 
 
 
382 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  40.86 
 
 
383 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  40.79 
 
 
385 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  40.66 
 
 
388 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.24 
 
 
414 aa  260  3e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  40.83 
 
 
383 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  38.78 
 
 
382 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  38.78 
 
 
382 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  37.14 
 
 
380 aa  256  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  38.78 
 
 
382 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  38.78 
 
 
382 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  38.78 
 
 
382 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  39.57 
 
 
379 aa  253  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  40.05 
 
 
387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.69 
 
 
384 aa  253  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  41 
 
 
383 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  41 
 
 
383 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  41 
 
 
383 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  40.33 
 
 
383 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  40.22 
 
 
385 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  40 
 
 
388 aa  245  9e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  38.32 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  38.86 
 
 
384 aa  244  3e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  41.6 
 
 
359 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.23 
 
 
385 aa  242  9e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  38.42 
 
 
388 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  38.38 
 
 
394 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  37.69 
 
 
393 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  36.48 
 
 
388 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.56 
 
 
392 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.95 
 
 
350 aa  233  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.95 
 
 
350 aa  233  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  38.3 
 
 
387 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  39.52 
 
 
387 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  39.45 
 
 
387 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  38.6 
 
 
372 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  32.45 
 
 
386 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  33.88 
 
 
387 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  40.27 
 
 
390 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.17 
 
 
412 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  38.72 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  35.47 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2677  cyclic nucleotide-binding protein  33.42 
 
 
393 aa  213  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  39.39 
 
 
369 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  33.78 
 
 
355 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  37.82 
 
 
389 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  40.78 
 
 
376 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  35.32 
 
 
400 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  38.99 
 
 
348 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  37.67 
 
 
361 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  35.53 
 
 
358 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  38.87 
 
 
373 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  37.82 
 
 
349 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  34.65 
 
 
381 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  34.65 
 
 
381 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  34.65 
 
 
381 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  37.32 
 
 
357 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  34.65 
 
 
381 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>