182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0678 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  99.21 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  89.79 
 
 		 382 aa  730    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  90.31 
 
 		 382 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  99.21 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  100 
 
 		 382 aa  792    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  89.01 
 
 		 382 aa  720    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  90.05 
 
 		 382 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  89.79 
 
 		 382 aa  729    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  98.95 
 
 		 382 aa  785    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  99.21 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  90.05 
 
 		 382 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  99.21 
 
 		 382 aa  787    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  98.69 
 
 		 382 aa  783    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  73.37 
 
 		 383 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  71.05 
 
 		 383 aa  568  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  72.06 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  72.06 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  72.06 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  70 
 
 		 383 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  64.47 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  64.02 
 
 		 386 aa  511  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  64.55 
 
 		 386 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  63.76 
 
 		 405 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  60.86 
 
 		 389 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  60.85 
 
 		 385 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  60 
 
 		 387 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  58.95 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  59.32 
 
 		 387 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  54.18 
 
 		 379 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  50.14 
 
 		 385 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  49.86 
 
 		 409 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  48.81 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  48.8 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  49.1 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  48.04 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  48.66 
 
 		 384 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  46.68 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  47.14 
 
 		 391 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  44.74 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  45.12 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  43.75 
 
 		 412 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.44 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.44 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.44 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.44 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.33 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  41.11 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  41.84 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.84 
 
 		 381 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  41.84 
 
 		 381 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  41.11 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  41.79 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  41.8 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.01 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  42.02 
 
 		 403 aa  292  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.44 
 
 		 385 aa  292  8e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  40.57 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  46.92 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  38.97 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.16 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.55 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  39.28 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  39.74 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  38.79 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  43.92 
 
 		 349 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.45 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  40.58 
 
 		 386 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  44.85 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.09 
 
 		 372 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  39.05 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.05 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.3 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  39.53 
 
 		 396 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.62 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.49 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  39.46 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  40.92 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  37.14 
 
 		 386 aa  256  6e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.58 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.63 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.29 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  39.94 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.11 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.11 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  41.53 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  40.88 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.7 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  41.18 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.01 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.76 
 
 		 356 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.52 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.24 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  34.12 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.28 
 
 		 373 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  36.41 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.01 
 
 		 351 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.05 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  38.48 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  35.88 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  38.76 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>