205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2212 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2212  galactokinase  100 
 
 		 399 aa  806    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  45.74 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  45.74 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  44.1 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  44.1 
 
 		 388 aa  325  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  44.78 
 
 		 392 aa  325  8.000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  44.5 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  45.61 
 
 		 389 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  45.65 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  43.59 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  44.39 
 
 		 389 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  44.1 
 
 		 386 aa  315  9e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  43.67 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  43.54 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  43.56 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.95 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  44.17 
 
 		 399 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  44.59 
 
 		 388 aa  298  8e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  44.76 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  41.3 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.1 
 
 		 394 aa  285  9e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  43.16 
 
 		 396 aa  279  6e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  41.67 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  39.58 
 
 		 383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  37.21 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.18 
 
 		 403 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  37.22 
 
 		 386 aa  259  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  36.04 
 
 		 404 aa  256  3e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  37.22 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  34.76 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  36.16 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  38.01 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  36.57 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  36.36 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  36.61 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  35.14 
 
 		 391 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  35.52 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  36.34 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  35.52 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  34.76 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  34.76 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  34.76 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  34.76 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  35.85 
 
 		 383 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  34.76 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  34.26 
 
 		 382 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  34.26 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  34.26 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  34.26 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  34.51 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  34.01 
 
 		 382 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  35.23 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.44 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  35.97 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  35.48 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  34.01 
 
 		 382 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.51 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  35.18 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  33.85 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  36.8 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  33.42 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  33.51 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.16 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.16 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  36.5 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  36.5 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  36.5 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  36.04 
 
 		 383 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  34.68 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  36.44 
 
 		 385 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  35.04 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  34.64 
 
 		 386 aa  222  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  35.64 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  35.5 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  34.85 
 
 		 387 aa  216  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  34.53 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  36.49 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  34.07 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  35.5 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.49 
 
 		 380 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  34.6 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  33.42 
 
 		 384 aa  208  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.26 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  33.42 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  32.75 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  30.65 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  32.91 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  31.65 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  32.81 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  36.47 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  32.31 
 
 		 380 aa  196  9e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  35.69 
 
 		 357 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  32.2 
 
 		 358 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  31.79 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  31.96 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  31.96 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  34 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  33.88 
 
 		 385 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  34.47 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  31.96 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>