169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3668 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  100 
 
 		 380 aa  782    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  68.87 
 
 		 381 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  63.59 
 
 		 381 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  63.59 
 
 		 381 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  63.59 
 
 		 381 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  63.59 
 
 		 381 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  63.59 
 
 		 381 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  62.27 
 
 		 381 aa  509  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  62.27 
 
 		 381 aa  508  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  62.01 
 
 		 381 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  61.48 
 
 		 381 aa  503  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  61.62 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  61.1 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  59.74 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  60.05 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  61.2 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  42.3 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  40.21 
 
 		 386 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  41.67 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  39.16 
 
 		 386 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.95 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  41.09 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  39.41 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  41.1 
 
 		 382 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  40.21 
 
 		 385 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  40.84 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  40.84 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  40.84 
 
 		 382 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  40.84 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  41.27 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  42.74 
 
 		 383 aa  298  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  39.58 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  39.31 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  39.31 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  39.31 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  42.25 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  39.31 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  39.31 
 
 		 382 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  41.01 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  38.79 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  40.63 
 
 		 383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.63 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.63 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.63 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  40.74 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  41.11 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  38.48 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  39.04 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  38.75 
 
 		 409 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  38.62 
 
 		 394 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  38.3 
 
 		 391 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  37.3 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  37.4 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  34.17 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  35.71 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  36.22 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  34.05 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  32.61 
 
 		 387 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  33.86 
 
 		 387 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  33.25 
 
 		 387 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  35.12 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  33.6 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  35.71 
 
 		 385 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  34.2 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  33.95 
 
 		 385 aa  209  4e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  35.11 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  33.08 
 
 		 399 aa  202  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  31.54 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  33.07 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  32.72 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  33.25 
 
 		 392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  35.01 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  36.34 
 
 		 409 aa  195  9e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  33 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  37.1 
 
 		 369 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  33.43 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.48 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  30.77 
 
 		 350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  30.77 
 
 		 350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.48 
 
 		 359 aa  190  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  31.28 
 
 		 389 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  34.93 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  30.53 
 
 		 383 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  36.16 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  31.01 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  29.9 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  34.52 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  30 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  33.33 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  31.43 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  33.9 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  34.93 
 
 		 376 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  34.57 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  33.68 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  32.92 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  29.95 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  33.68 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  28.2 
 
 		 395 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  31.48 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  32.15 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>