220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1938 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  100 
 
 		 369 aa  753    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  53.85 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  57.67 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  53.41 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  52.56 
 
 		 357 aa  359  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  54.23 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  52.33 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  44.44 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  43.1 
 
 		 391 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  41.83 
 
 		 383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.18 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  39.47 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  39.44 
 
 		 388 aa  249  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  40.91 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  46.5 
 
 		 376 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  40.91 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  40.91 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  45.54 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  39.78 
 
 		 405 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  41.16 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  40.33 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  40.88 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  40.61 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  41.05 
 
 		 382 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  41.16 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  41.16 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  41.16 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  40.72 
 
 		 382 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  41.16 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  40.83 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  40.83 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  40.83 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  40.88 
 
 		 382 aa  238  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  38.8 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.55 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  41 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  43.27 
 
 		 387 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  37.89 
 
 		 379 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  37.87 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  39.43 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  39.72 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.79 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  42.86 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  39.89 
 
 		 409 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  39.67 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  37.43 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  41.26 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  37.78 
 
 		 384 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  38.15 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  39.67 
 
 		 385 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  40.88 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.37 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.37 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.81 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  36.13 
 
 		 387 aa  223  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.68 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  37.61 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  37.5 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.42 
 
 		 414 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.66 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  35.93 
 
 		 387 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  37.5 
 
 		 389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.32 
 
 		 385 aa  215  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.53 
 
 		 399 aa  215  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.73 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  39.01 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  41.53 
 
 		 390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  40.85 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.12 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  39.39 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  39.67 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.81 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  35.6 
 
 		 386 aa  208  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.83 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  40.62 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.5 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  39.04 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  37.88 
 
 		 418 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  36.11 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  40.06 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  38.59 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  39.72 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  43.14 
 
 		 379 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  39.09 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  36.6 
 
 		 381 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  36.6 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  36.6 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  36.6 
 
 		 381 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.56 
 
 		 351 aa  202  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  35.75 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  34.44 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  34.57 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  40 
 
 		 400 aa  199  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  35.73 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  44.01 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  35.1 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  40.55 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  35.06 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  33.72 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  35.33 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>