192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2481 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  100 
 
 
348 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  57.67 
 
 
369 aa  363  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  57.3 
 
 
356 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  56.7 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  54.13 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  54.6 
 
 
359 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  56.23 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  42.86 
 
 
383 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  41.26 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  40.98 
 
 
386 aa  242  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  43.54 
 
 
391 aa  242  7e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  43.28 
 
 
383 aa  242  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  43.28 
 
 
383 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  43.28 
 
 
383 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  41.46 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  41.46 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  41.46 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  41.74 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  41.46 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  41.46 
 
 
382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  40.61 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  41.71 
 
 
382 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  41.71 
 
 
382 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  41.18 
 
 
382 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  38.63 
 
 
385 aa  238  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  41.71 
 
 
382 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  41.18 
 
 
382 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  41.71 
 
 
382 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  41.71 
 
 
382 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  44.17 
 
 
383 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  42.78 
 
 
391 aa  235  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  40.54 
 
 
393 aa  233  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  43.28 
 
 
383 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  39.65 
 
 
387 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  41.76 
 
 
392 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  40.06 
 
 
388 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  39.61 
 
 
389 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  39.39 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  44.35 
 
 
349 aa  224  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  39.39 
 
 
385 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  37.5 
 
 
379 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  41.22 
 
 
403 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  35.6 
 
 
387 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  39.61 
 
 
385 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  42.27 
 
 
387 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.72 
 
 
355 aa  216  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  36.49 
 
 
399 aa  214  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  36.64 
 
 
386 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  35.54 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  35.54 
 
 
387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  36.53 
 
 
394 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  40.56 
 
 
391 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  41.06 
 
 
376 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  36.26 
 
 
387 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.22 
 
 
384 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  35.15 
 
 
388 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  37.53 
 
 
389 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  39.5 
 
 
389 aa  209  8e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.42 
 
 
372 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  38.99 
 
 
396 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.73 
 
 
414 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  38.86 
 
 
404 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  36.22 
 
 
389 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  42.18 
 
 
389 aa  205  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  37.88 
 
 
412 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  37.57 
 
 
385 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  35.04 
 
 
387 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  37.36 
 
 
392 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  37.28 
 
 
350 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  37.28 
 
 
350 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.46 
 
 
388 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.62 
 
 
392 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37.75 
 
 
394 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.95 
 
 
387 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  38.95 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.69 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  34.44 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.17 
 
 
398 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  42.3 
 
 
390 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  40.22 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.52 
 
 
405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  45.27 
 
 
379 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  44.63 
 
 
376 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  38.66 
 
 
382 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  32.04 
 
 
386 aa  194  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  36.01 
 
 
388 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  42.17 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.99 
 
 
351 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  37.57 
 
 
390 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  41.19 
 
 
403 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.58 
 
 
386 aa  186  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.44 
 
 
373 aa  186  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  33.51 
 
 
399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.97 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  36.56 
 
 
416 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  32.24 
 
 
380 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  34.86 
 
 
388 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  40.77 
 
 
407 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  38.19 
 
 
418 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36.66 
 
 
440 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>