183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2885 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  100 
 
 
382 aa  792    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  90.58 
 
 
382 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  90.58 
 
 
382 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  91.1 
 
 
382 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  100 
 
 
382 aa  792    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  99.21 
 
 
382 aa  787    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  89.79 
 
 
382 aa  725    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  90.84 
 
 
382 aa  737    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  99.74 
 
 
382 aa  790    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  100 
 
 
382 aa  792    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  90.58 
 
 
382 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  100 
 
 
382 aa  792    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  99.48 
 
 
382 aa  788    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  74.15 
 
 
383 aa  581  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  71.84 
 
 
383 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  72.58 
 
 
383 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  72.58 
 
 
383 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  72.58 
 
 
383 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  70.79 
 
 
383 aa  548  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  65 
 
 
387 aa  514  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  64.55 
 
 
386 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  65.08 
 
 
386 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  64.29 
 
 
405 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  61.39 
 
 
389 aa  485  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  61.38 
 
 
385 aa  488  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  60.53 
 
 
387 aa  457  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  59.47 
 
 
387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  59.84 
 
 
387 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  54.72 
 
 
379 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  50.68 
 
 
409 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  50.95 
 
 
385 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  49.87 
 
 
393 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  49.34 
 
 
388 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  49.33 
 
 
388 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  48.83 
 
 
394 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  49.2 
 
 
384 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  47.21 
 
 
388 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  47.92 
 
 
391 aa  355  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  45.26 
 
 
385 aa  350  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  45.91 
 
 
391 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.97 
 
 
381 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.97 
 
 
381 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.97 
 
 
381 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.97 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  44.02 
 
 
412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.86 
 
 
382 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  42.11 
 
 
381 aa  322  8e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.91 
 
 
381 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  42.37 
 
 
381 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  42.37 
 
 
381 aa  316  6e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  41.64 
 
 
381 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.56 
 
 
404 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  43.54 
 
 
392 aa  301  9e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  42.08 
 
 
387 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  41.09 
 
 
387 aa  295  7e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  42.82 
 
 
403 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  47.72 
 
 
390 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.71 
 
 
385 aa  293  4e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  39.95 
 
 
398 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  40.05 
 
 
389 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.68 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  39.31 
 
 
380 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  40 
 
 
389 aa  282  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.82 
 
 
394 aa  282  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  44.51 
 
 
349 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  41.38 
 
 
386 aa  279  8e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.74 
 
 
414 aa  276  4e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  45.12 
 
 
380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  42.2 
 
 
372 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.52 
 
 
388 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  39.31 
 
 
387 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.31 
 
 
387 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.32 
 
 
396 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  40.27 
 
 
397 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.36 
 
 
392 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  41.73 
 
 
405 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.49 
 
 
359 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  37.05 
 
 
386 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  41.1 
 
 
390 aa  255  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.9 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.22 
 
 
392 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  37.37 
 
 
395 aa  249  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.29 
 
 
383 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.09 
 
 
376 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.76 
 
 
399 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  38.85 
 
 
389 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.96 
 
 
388 aa  241  1e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  41.16 
 
 
369 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  41.46 
 
 
348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  36.8 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.76 
 
 
356 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.5 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  39.07 
 
 
373 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.68 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.29 
 
 
351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  35.88 
 
 
385 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  37.18 
 
 
388 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  38.52 
 
 
401 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  38.46 
 
 
349 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  39.05 
 
 
357 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>