185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03327 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  96.11 
 
 		 386 aa  769    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  100 
 
 		 386 aa  794    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  76.88 
 
 		 405 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  75.72 
 
 		 387 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  66.06 
 
 		 385 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  64.02 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  62.8 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  64.29 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  62.53 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  62.53 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  62.8 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  62.8 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  62.7 
 
 		 382 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  66.58 
 
 		 383 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  63.44 
 
 		 383 aa  499  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  65.27 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  64.08 
 
 		 383 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  65.35 
 
 		 387 aa  497  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  61.21 
 
 		 389 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  63.16 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  63.16 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  63.16 
 
 		 383 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  60 
 
 		 387 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  53.3 
 
 		 385 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  53.03 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  54.67 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  51.3 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  51.05 
 
 		 388 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  50.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  48.44 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  50 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  49.1 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  47.55 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  47.51 
 
 		 391 aa  348  7e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  48.02 
 
 		 391 aa  346  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  46.2 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  44.36 
 
 		 398 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.19 
 
 		 381 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  41.93 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  41.41 
 
 		 381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  40.78 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.15 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.34 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  40.89 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  46.42 
 
 		 403 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  45.97 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  43.52 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  40.21 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  43.88 
 
 		 404 aa  305  7e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  40.26 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.74 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  37.76 
 
 		 381 aa  299  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  42.56 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  44.66 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.97 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  46.09 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  42.38 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  39.06 
 
 		 392 aa  284  1.0000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  43.09 
 
 		 372 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  41.69 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  42.11 
 
 		 389 aa  279  5e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.83 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  40.21 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  42.15 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  39.53 
 
 		 386 aa  278  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.83 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  42.82 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  38.93 
 
 		 386 aa  272  9e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  43.63 
 
 		 376 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.79 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  41.01 
 
 		 359 aa  268  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  40.42 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  39.13 
 
 		 394 aa  264  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.99 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  39.9 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  39.79 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  37.22 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  40.23 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  39.95 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  36.34 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  39.42 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.79 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  40.27 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  39.7 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.6 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  36.93 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  38.81 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  39.47 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  40.98 
 
 		 348 aa  242  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.2 
 
 		 383 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  35.93 
 
 		 440 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.17 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>