180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2085 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  100 
 
 		 385 aa  795    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  66.06 
 
 		 386 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  65.01 
 
 		 386 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  65.62 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  64.49 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  61.11 
 
 		 382 aa  488  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  61.38 
 
 		 382 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  61.38 
 
 		 382 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  61.38 
 
 		 382 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  61.38 
 
 		 382 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  61.38 
 
 		 382 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  61.11 
 
 		 382 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  62.63 
 
 		 383 aa  481  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  61.05 
 
 		 382 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  61.05 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  60.42 
 
 		 382 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  61.05 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  60.85 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  60.69 
 
 		 382 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  60.79 
 
 		 383 aa  476  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  61.58 
 
 		 383 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  60.16 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  60.16 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  60.16 
 
 		 383 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  58.18 
 
 		 387 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  55.15 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  59.36 
 
 		 387 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  58.82 
 
 		 387 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  51.61 
 
 		 379 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  48.95 
 
 		 388 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  50.26 
 
 		 384 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  49.61 
 
 		 388 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  48.68 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  48.31 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  48.56 
 
 		 388 aa  368  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  48.41 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  44.99 
 
 		 393 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  46.42 
 
 		 391 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  46.7 
 
 		 412 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  44.79 
 
 		 394 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  46.26 
 
 		 391 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.78 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  40.73 
 
 		 381 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  40.73 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  40.73 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  40.73 
 
 		 381 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  41.51 
 
 		 381 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  41.25 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  40.73 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  40.21 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  41.41 
 
 		 382 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  45.43 
 
 		 404 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  44.39 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  39.95 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  42.74 
 
 		 398 aa  292  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  42.35 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  42.93 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  40.62 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  41.93 
 
 		 387 aa  282  7.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  43.3 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.84 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  38.12 
 
 		 381 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  44.04 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  38.36 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  39.84 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.5 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.64 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  43.48 
 
 		 349 aa  263  6e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.85 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  41.1 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.08 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  39.28 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  40.98 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.16 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  42.75 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  39.49 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.22 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.14 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.64 
 
 		 373 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  39.47 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  37.77 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  38.2 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  39.78 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  37.63 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  37.4 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  37.57 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  39.29 
 
 		 391 aa  232  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  39.79 
 
 		 369 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  39.04 
 
 		 376 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  36.54 
 
 		 414 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  36.31 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  37.57 
 
 		 358 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  38.46 
 
 		 351 aa  229  8e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  34.74 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  37.86 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36.25 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  36.95 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  38.87 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  38.54 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  36.46 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>