178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0502 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  100 
 
 		 384 aa  776    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  37.99 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  38.42 
 
 		 405 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.08 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.6 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  36.06 
 
 		 398 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.38 
 
 		 383 aa  223  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  37.71 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.71 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  38.8 
 
 		 409 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  37.71 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  37.71 
 
 		 382 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  37.43 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  38.73 
 
 		 391 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  36.46 
 
 		 403 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  38.64 
 
 		 372 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  38.28 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  35.14 
 
 		 395 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  36.73 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  34.92 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  35.23 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  35.31 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  33.51 
 
 		 386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  39.63 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  39.01 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  32.9 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  35.31 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  34.11 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  36.09 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  35.93 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  35.16 
 
 		 404 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  40.24 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  35.93 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  35.93 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  35.93 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  34.19 
 
 		 386 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  43.06 
 
 		 373 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.72 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.72 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  35.86 
 
 		 379 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  37.53 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  36.49 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  35.65 
 
 		 382 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  37.57 
 
 		 385 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  34.46 
 
 		 386 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  35.56 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.01 
 
 		 351 aa  205  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  39.26 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  34.55 
 
 		 394 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  34.32 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  39.35 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  41.19 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  35.03 
 
 		 391 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  33.16 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  33.87 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  41.64 
 
 		 376 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  34.7 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  32.38 
 
 		 387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  32.9 
 
 		 389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  36.12 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  36.12 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  36.12 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  33.33 
 
 		 385 aa  196  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  36.72 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  33.07 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  35.81 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  35.95 
 
 		 387 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  36.46 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  32.5 
 
 		 397 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  38.55 
 
 		 389 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.03 
 
 		 385 aa  192  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  35.36 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  35.49 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  31.59 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  37.61 
 
 		 383 aa  188  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  33.24 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  31.5 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  31.5 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  31.88 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  31.43 
 
 		 388 aa  186  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  35.14 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  33.96 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  38.77 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  36.51 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  31.88 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  30.41 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  33.16 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  33.33 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  28.76 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  37.5 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  32.76 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  34.93 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  33.51 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  35.71 
 
 		 362 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  35 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  34.12 
 
 		 369 aa  170  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  33.25 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  32.14 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  36.16 
 
 		 403 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  32.65 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>