45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1732 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  100 
 
 		 349 aa  718    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  33.23 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  33.53 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.24 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  27.96 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  26.37 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.24 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  24.33 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  24.92 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.36 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  23.69 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  25.24 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  21.81 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  26.43 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.68 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  22.82 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  21.59 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  24.36 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  23.08 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  24.5 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.23 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  23.55 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  22.12 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  22.15 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  22.33 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  21.98 
 
 		 322 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  23.83 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  21.41 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  23.12 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  21.36 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  23.4 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  23.4 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  22.67 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  21.12 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  25.7 
 
 		 314 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  19.89 
 
 		 276 aa  46.6  0.0007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  21.28 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  23.15 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  25.49 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  21.96 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  21.35 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  22.36 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  26.29 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>