120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0580 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  90.54 
 
 
317 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  90.22 
 
 
317 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  72.7 
 
 
319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  52.27 
 
 
356 aa  286  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  32.79 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  31.75 
 
 
327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  30.84 
 
 
303 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  31.38 
 
 
338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  32.07 
 
 
290 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  31.55 
 
 
328 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  30.79 
 
 
316 aa  109  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  29.33 
 
 
315 aa  103  4e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  33.9 
 
 
336 aa  102  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.45 
 
 
322 aa  102  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  27.7 
 
 
310 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  30.85 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  30.13 
 
 
306 aa  100  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  28.57 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  26.07 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  30.32 
 
 
330 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  31.76 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  26.44 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.51 
 
 
432 aa  96.3  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  32.32 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.7 
 
 
340 aa  95.5  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  26.06 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.67 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  29.84 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  28.53 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  25.7 
 
 
340 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.95 
 
 
375 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  26.71 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  27.18 
 
 
322 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  30.18 
 
 
301 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.09 
 
 
361 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.73 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.27 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.27 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  29.66 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  29.66 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  30.5 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  28.89 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  30.06 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  27.46 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.76 
 
 
900 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  21.85 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  22.87 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  25.97 
 
 
735 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  32.12 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  25.72 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  27.15 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  25.56 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  25.56 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  26.25 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  26.06 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  26.79 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  25.8 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  22.65 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  22.61 
 
 
369 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  24.19 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  29.35 
 
 
276 aa  63.5  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  21.73 
 
 
393 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  27.7 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.58 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.04 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  24.35 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  25.65 
 
 
490 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  24.47 
 
 
349 aa  57  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1281  homoserine kinase  25.68 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.045186  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  23.17 
 
 
359 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  22.38 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  20.83 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  21.68 
 
 
391 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  23.77 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  23.2 
 
 
414 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  22.22 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  21.93 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  27.84 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  32.5 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  21.16 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  20.95 
 
 
416 aa  50.8  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  23.58 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  24.92 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  20.58 
 
 
387 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  28.72 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  23.48 
 
 
394 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  22.08 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  23.5 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  21.88 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  23.28 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  23.5 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  30 
 
 
779 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  22.66 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  23.28 
 
 
345 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  22.75 
 
 
403 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  26.92 
 
 
339 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  26.67 
 
 
350 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  25.57 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  21.85 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>