29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1387 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  100 
 
 		 339 aa  691    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0456  phosphomevalonate kinase  32.59 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  31.93 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0240  phosphomevalonate kinase  27.5 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  27.02 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  27.02 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  29.26 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0600  phosphomevalonate kinase  27.49 
 
 		 331 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0314  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 2  24.27 
 
 		 779 aa  80.5  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0544804 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1324  phosphomevalonate kinase  24.11 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  24.32 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  30.23 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  30.23 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  25.58 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  28.8 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52257  Phosphomevalonate kinase  26.22 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.435528  normal  0.126938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  23.7 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.47 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.08 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  24.31 
 
 		 316 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  26.92 
 
 		 317 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  27.44 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  26.92 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  24.16 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25.11 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  26.32 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  22.36 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  26.45 
 
 		 314 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1122  GHMP kinase  28.16 
 
 		 288 aa  42.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>