154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0454 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  100 
 
 		 310 aa  635    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  49.5 
 
 		 310 aa  311  1e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  42.16 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  40.46 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  37.75 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  38.28 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  34.19 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  34.53 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  34.53 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  36.81 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  36.22 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  31.92 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.23 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  32.12 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  31.95 
 
 		 400 aa  136  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  33.45 
 
 		 276 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  33.01 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  31.69 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  30.07 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  28.82 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.52 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  29 
 
 		 309 aa  90.5  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  29.59 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  31.69 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.53 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.48 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  27.96 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  26.99 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  26.83 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  32.45 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.08 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  27.41 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  31.01 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  28.43 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.1 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  26.5 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  25.8 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.56 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.47 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  27.8 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  26.06 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.48 
 
 		 317 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  27.92 
 
 		 372 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.81 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  25.16 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  24.66 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  24.66 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.18 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.75 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  24.75 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  26.25 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.17 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  26.29 
 
 		 400 aa  67  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  23.69 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  47.5 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.84 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  27.63 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  24.83 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  28.06 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  25.48 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.76 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  23.89 
 
 		 391 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  29.03 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24.78 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  26.46 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.15 
 
 		 900 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  24.52 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  24.52 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  27.69 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  24.7 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  31.62 
 
 		 416 aa  56.6  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  24.36 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  26.64 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  23.58 
 
 		 408 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  25.54 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  28.62 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  26.32 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  24.2 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  35.05 
 
 		 396 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1387  mevalonate kinase-like protein  25.34 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.73 
 
 		 395 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  20.55 
 
 		 386 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0622  protein containing mevalonate and galactokinase signatures  25.85 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  36.7 
 
 		 488 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  26.47 
 
 		 351 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.7 
 
 		 348 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  23.27 
 
 		 389 aa  52.8  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25.21 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  26.8 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  23.85 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  23.23 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  35.96 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  25.1 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  24.48 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  25.3 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04600  mevalonate kinase  24.16 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.797407  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  23.86 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  21.53 
 
 		 387 aa  50.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  19.81 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>