80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1812 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  73.08 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  71.53 
 
 		 289 aa  414  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  66.9 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  64.46 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  39.8 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  38.7 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  39.22 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  34.04 
 
 		 327 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  34.23 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  34.5 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  35.84 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  36.67 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  34.74 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  33.02 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  35.03 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  31.54 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  32.23 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  28.11 
 
 		 356 aa  99.4  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  27.46 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  33.8 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  30.41 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.11 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.46 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  28.11 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  34.38 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  27.74 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  31.82 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.69 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  27.08 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  27.08 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  32.3 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  31.46 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  32.18 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  28.62 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.32 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  29.57 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  30.22 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  30.04 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  27.94 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  24.65 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  26.72 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  31.42 
 
 		 735 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  26.35 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  25.99 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  27.12 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  30.04 
 
 		 900 aa  68.9  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.69 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.66 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.66 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  26.91 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  29.71 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.44 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.86 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.46 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  24.48 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.05 
 
 		 349 aa  52.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.89 
 
 		 356 aa  52.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  25.6 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  27.85 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.56 
 
 		 405 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  43.48 
 
 		 488 aa  50.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  25.8 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  28.38 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.71 
 
 		 490 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  25.59 
 
 		 385 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  26.32 
 
 		 349 aa  46.6  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  23.88 
 
 		 416 aa  46.2  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25.23 
 
 		 372 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  23.44 
 
 		 380 aa  46.2  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  42.11 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  23.81 
 
 		 350 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.39 
 
 		 340 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  25.1 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  23.63 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  28.49 
 
 		 284 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  34.31 
 
 		 347 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.05 
 
 		 340 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  23.13 
 
 		 333 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>