182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0236 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  100 
 
 
350 aa  715    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  44.54 
 
 
339 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  46.09 
 
 
346 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  44.08 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  41.64 
 
 
343 aa  232  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  39.41 
 
 
339 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  39.71 
 
 
339 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  39.77 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10116  D-alpha-D-heptose-7-phosphate kinase hddA  42.69 
 
 
386 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  39.77 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  39.53 
 
 
337 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  40 
 
 
345 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  37.65 
 
 
336 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  40.12 
 
 
347 aa  192  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  41.02 
 
 
347 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  35.84 
 
 
347 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  33.94 
 
 
333 aa  159  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0788  GHMP kinase  34.38 
 
 
328 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  32.29 
 
 
328 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0147  GHMP kinase  33.63 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  35.51 
 
 
359 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0206  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase, putative  32.75 
 
 
325 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5465  GHMP kinase  36.9 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  30.28 
 
 
293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3977  GHMP kinase  35.17 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  34.03 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  34.03 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  35.65 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  29.76 
 
 
333 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  31.4 
 
 
354 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0793  GHMP kinase  30.48 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  31.92 
 
 
354 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  29.49 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.99 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  26.2 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.09 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3600  GHMP kinase  28.97 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.2 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  25.21 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  24.22 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  25.54 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.48 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  27.49 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  23.91 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.37 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  29.35 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  29.35 
 
 
350 aa  72.8  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  25.94 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.72 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.89 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  29.67 
 
 
321 aa  67  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  25.21 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  24.06 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  30.25 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  28.64 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  26.67 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  26.09 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  27 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  25.3 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  23.23 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.38 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.38 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.21 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  25.55 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  24.15 
 
 
314 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.21 
 
 
388 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  26.67 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.94 
 
 
383 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.6 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  24.04 
 
 
405 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  27.88 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25.56 
 
 
372 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1872  shikimate kinase  38.14 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.464279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  24.41 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  28.49 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  24.85 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  32.39 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.18 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  31.93 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  24.15 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  25 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.21 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  21.55 
 
 
314 aa  56.6  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  30.41 
 
 
382 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.21 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  30.41 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  30.41 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.21 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.21 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.21 
 
 
382 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  23.8 
 
 
384 aa  56.2  0.0000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.58 
 
 
382 aa  56.2  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  30.41 
 
 
382 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>