145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3409 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  100 
 
 
347 aa  669    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  36.25 
 
 
314 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  35.99 
 
 
322 aa  133  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  37.06 
 
 
316 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  37.3 
 
 
321 aa  116  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  32.08 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  29.67 
 
 
306 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  28.76 
 
 
310 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  30.31 
 
 
316 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  28.62 
 
 
322 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  25.73 
 
 
276 aa  102  9e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  27.81 
 
 
310 aa  99.8  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  28.08 
 
 
303 aa  99.4  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  33.65 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  32.18 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  28.25 
 
 
313 aa  94.7  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  32.05 
 
 
314 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  33.44 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  25.82 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  29.65 
 
 
286 aa  86.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  29.58 
 
 
900 aa  84.3  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  28.7 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  28.85 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  25.83 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  33.64 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  26.43 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  26.43 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  28.34 
 
 
735 aa  77.8  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  28.35 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  34.18 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  31.27 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.56 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  32.14 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  22.95 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  26.15 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  26.46 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  34.35 
 
 
349 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.68 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  32.6 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  27.04 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  29.17 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  42.59 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  27.3 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  36.55 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  23.34 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.43 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  26.48 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25.44 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  26.79 
 
 
343 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  25.63 
 
 
297 aa  63.2  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  24.2 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  24.2 
 
 
313 aa  63.2  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  31.8 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  26.17 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  23.13 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  22.7 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  27.32 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.47 
 
 
361 aa  60.1  0.00000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  27.32 
 
 
339 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  28.27 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  27.32 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  26.81 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  32.57 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  21.34 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  29.66 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.29 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  29.66 
 
 
357 aa  56.2  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  31.58 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  30.13 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  38.02 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  27.9 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  33.6 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  30.77 
 
 
351 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  37.11 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  28.77 
 
 
333 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  24.68 
 
 
351 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  27.69 
 
 
358 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  25.08 
 
 
314 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1575  phosphomevalonate kinase  25.61 
 
 
322 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00534382 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  22.95 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  30.05 
 
 
341 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  27.25 
 
 
314 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  29.29 
 
 
391 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  32.22 
 
 
408 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  36.36 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1102  phosphomevalonate kinase  27.23 
 
 
249 aa  49.3  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.029164  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  30.59 
 
 
524 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  41.18 
 
 
407 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  32.46 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  31.09 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  29.91 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  36.11 
 
 
386 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  40.28 
 
 
390 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0615  phosphomevalonate kinase  21.43 
 
 
358 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0630  phosphomevalonate kinase  21.43 
 
 
358 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  38.1 
 
 
394 aa  46.6  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  37.72 
 
 
400 aa  46.6  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  24.67 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  24.67 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>