80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0467 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  67.74 
 
 
314 aa  442  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  68.4 
 
 
315 aa  434  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  66.02 
 
 
310 aa  422  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  42.11 
 
 
336 aa  152  5e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  35.13 
 
 
316 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  35.84 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  32.94 
 
 
314 aa  123  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  32.6 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  32.06 
 
 
303 aa  116  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  32.01 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  33.08 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  30.51 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  33.77 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  32.53 
 
 
328 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  31.86 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  30.07 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  30.07 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.49 
 
 
356 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  29.77 
 
 
356 aa  86.3  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  32.53 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.79 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.53 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.89 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  28.41 
 
 
317 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  31.97 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.03 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.85 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  29.63 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  28.53 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  27.76 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.19 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.86 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  29.05 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  29.05 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  25.78 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.75 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.69 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  25.78 
 
 
361 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  27.78 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  25.75 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  21.49 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  25.7 
 
 
316 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  29.97 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.27 
 
 
403 aa  59.3  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  21.49 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  25.73 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  30.55 
 
 
289 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.29 
 
 
375 aa  57  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  27.1 
 
 
400 aa  56.2  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  24.66 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.29 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.29 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.39 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  24.33 
 
 
351 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  22.87 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  25.91 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1035  phosphomevalonate kinase  21.76 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  27.46 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.35 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  22.56 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25 
 
 
349 aa  49.7  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  28.72 
 
 
382 aa  49.7  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  23.84 
 
 
293 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  24.37 
 
 
735 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0214  GHMP kinase  23.86 
 
 
355 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0700927  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.15 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  27.71 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  23.49 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  26.6 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  25.34 
 
 
292 aa  47  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.06 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  24.42 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  27.04 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  25.38 
 
 
376 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1387  phosphomevalonate kinase  26.45 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  23.78 
 
 
386 aa  43.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0782  GHMP kinase  21.56 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  22.88 
 
 
339 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  26.25 
 
 
391 aa  42.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>