55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40742 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  100 
 
 
432 aa  892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  38.77 
 
 
735 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  38.54 
 
 
900 aa  249  6e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  30.15 
 
 
490 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.16 
 
 
322 aa  123  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  27.49 
 
 
313 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  28.33 
 
 
314 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.34 
 
 
316 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  27.04 
 
 
338 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  29.43 
 
 
321 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.97 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  26.89 
 
 
327 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  26.38 
 
 
303 aa  92  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  27.73 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.78 
 
 
313 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  35.71 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  26.01 
 
 
314 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  27.68 
 
 
289 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  25 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  30.88 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  31.55 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  27.15 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  27.68 
 
 
328 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  26.21 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  24.69 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.14 
 
 
340 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  22.87 
 
 
340 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  25.48 
 
 
310 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  28.88 
 
 
336 aa  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  27.53 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  27.73 
 
 
276 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  33.96 
 
 
289 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.3 
 
 
295 aa  60.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  47.69 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  22.62 
 
 
306 aa  59.7  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  25.21 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  25.29 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.7 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  24.56 
 
 
319 aa  53.5  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  24.86 
 
 
316 aa  53.1  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  24.05 
 
 
361 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  26.56 
 
 
356 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  28.95 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  25 
 
 
316 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  25.37 
 
 
314 aa  50.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  22.2 
 
 
389 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  28.46 
 
 
306 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  28.46 
 
 
306 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  21.28 
 
 
349 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  27.75 
 
 
322 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  25.56 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  22.64 
 
 
310 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  22.25 
 
 
375 aa  43.9  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>