229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1114 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  100 
 
 
382 aa  759    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  44.09 
 
 
361 aa  276  3e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  44.62 
 
 
359 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  41.91 
 
 
355 aa  220  3e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  35.11 
 
 
359 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  31.17 
 
 
380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  30.75 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  31.51 
 
 
372 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  32.29 
 
 
391 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0758  galactokinase  32.98 
 
 
429 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.558541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  30.56 
 
 
391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  31.71 
 
 
349 aa  120  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  31.67 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  27.54 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  27.14 
 
 
351 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  25.5 
 
 
387 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  29.1 
 
 
386 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  29.85 
 
 
388 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  29.51 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  25.5 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  29.51 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  31.37 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  31.37 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  27.35 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  27.88 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  27.27 
 
 
387 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  26.86 
 
 
382 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  28.09 
 
 
379 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  30.65 
 
 
407 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  27.97 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25.65 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  28.21 
 
 
387 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  25.65 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25.65 
 
 
382 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  26 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  29.92 
 
 
358 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  28.33 
 
 
386 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25.36 
 
 
382 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  31.71 
 
 
349 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  28.92 
 
 
401 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  29.74 
 
 
404 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  28.88 
 
 
416 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  32.07 
 
 
373 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  28.9 
 
 
389 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  29.97 
 
 
414 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  26.78 
 
 
389 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  28.1 
 
 
391 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  25.56 
 
 
383 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  32.12 
 
 
360 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  27.82 
 
 
385 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  28.74 
 
 
389 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  26.29 
 
 
383 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  27.61 
 
 
399 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  29.82 
 
 
369 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  26.21 
 
 
382 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  31.72 
 
 
409 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  30.2 
 
 
356 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  31.71 
 
 
357 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  28.31 
 
 
387 aa  102  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  31.25 
 
 
348 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  27.79 
 
 
384 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  27.93 
 
 
409 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  28.12 
 
 
395 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  31.68 
 
 
382 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  28.15 
 
 
351 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  27.32 
 
 
355 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  28.21 
 
 
388 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  29.11 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  25.76 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  29.3 
 
 
412 aa  99.4  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  27.65 
 
 
398 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  27.73 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  31.48 
 
 
414 aa  98.6  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  26.39 
 
 
361 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  28.72 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  28.41 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  28 
 
 
395 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  24.35 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  28.49 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  26.67 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32880  galactokinase  30.77 
 
 
409 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226542  normal  0.212245 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  25.21 
 
 
392 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  28.69 
 
 
387 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  28.05 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  26.85 
 
 
383 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24040  galactokinase  29.49 
 
 
420 aa  93.2  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  30.73 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  28.72 
 
 
370 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  28.25 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  26.21 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  27.46 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  29.67 
 
 
403 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  31.19 
 
 
380 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>