182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0465 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  100 
 
 		 360 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  58.89 
 
 		 370 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.75 
 
 		 361 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  32.12 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  33.43 
 
 		 1782 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.22 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  26.5 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  28.4 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  26.33 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  26.33 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25.34 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  25.63 
 
 		 389 aa  86.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  25.59 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  25.7 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  24.21 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.93 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.45 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  24.63 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  27.12 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  26.54 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  26.22 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  26.27 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  23.72 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  24.93 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  24.93 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.56 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  24.61 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  24.93 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  24.93 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  26.94 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  24.71 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  23.99 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  24.65 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  24.31 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.93 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  25.28 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  25.15 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  24.5 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  25.95 
 
 		 351 aa  72  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.24 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.22 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  27.4 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  25.22 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  26.11 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  24.72 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  25 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  26.3 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  24.14 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  25.07 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  25.21 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  25.64 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  24.54 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  24.54 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  26.24 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  24.23 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  24.85 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  24.03 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  24.1 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  25.07 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  23.16 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  24.65 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  24.79 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  23.98 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  24.58 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  23.68 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  25.73 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  26.67 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  24.07 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  26.17 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  25.63 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  24.02 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  24.36 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  24.62 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  25.82 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  24.29 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  24.23 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  25.35 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  26.07 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  25.21 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  31.06 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  23.89 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.15 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  28.65 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  28.34 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  23.98 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  23.85 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  24.78 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  45.24 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  23.15 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  32.7 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  33.13 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  32.7 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.86 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>