200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1000 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  100 
 
 		 370 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  58.89 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  33.77 
 
 		 1782 aa  153  5.9999999999999996e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  28.57 
 
 		 359 aa  133  6e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  30.42 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.99 
 
 		 355 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  28.72 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  27.2 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  28.2 
 
 		 359 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25.2 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  25.96 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.47 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.28 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  26.76 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  25.73 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  28.44 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.17 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  26.76 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  27.63 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  25.51 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  25.86 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  26.67 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  25.93 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  26.16 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  25.23 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.97 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  26.72 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  28.17 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.09 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  26.67 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  27.58 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  26.79 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  25.79 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  25.42 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  26.94 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  26.94 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  26.94 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  26.94 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  27.22 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  25.55 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  23.95 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  25.74 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  24.3 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25.82 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  25.67 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25.55 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  25.82 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.61 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.38 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  25.6 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  24.93 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  27.94 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  25.42 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  25.27 
 
 		 382 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  27.51 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  25.22 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  24.55 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  26.67 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  25.44 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  23.96 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  25.36 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  24.71 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  26.2 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  24.72 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  26.92 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  25.41 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  26.32 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  26.63 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  23.32 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  25.46 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  26.02 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  24.09 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.92 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  25.82 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  23.98 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  27.48 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  22.87 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  25.35 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  23.66 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  26 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  26.67 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  24.03 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  22.75 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  24.94 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  26.13 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  21.66 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  23.68 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.12 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  25.81 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  23.94 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  25.26 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  25.55 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  25.93 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  23.6 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  27.17 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  24.73 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  26.17 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  21.72 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>