224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0776 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  100 
 
 		 355 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  64.36 
 
 		 359 aa  442  1e-123  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  39.89 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  41.91 
 
 		 382 aa  220  3e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  28.4 
 
 		 380 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  32.35 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  33.23 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  30.93 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  31.42 
 
 		 349 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.98 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  30.03 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  31.82 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  30 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  30.3 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.85 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  27.54 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  25.99 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  27.99 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  28.29 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.36 
 
 		 403 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  28.95 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  28.95 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  29.28 
 
 		 394 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  28.7 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  28.4 
 
 		 398 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0997  galactokinase  28.86 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00864415  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.78 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  28.36 
 
 		 383 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  26.81 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  27.35 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  27.25 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  24.67 
 
 		 389 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  26.58 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  29.69 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  26.01 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  26.3 
 
 		 386 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  26.84 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  27.09 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  28.03 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  25.15 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  24.78 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  24.27 
 
 		 386 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  24.44 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  24.44 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  26.9 
 
 		 372 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  24.86 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  25.78 
 
 		 404 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  26.22 
 
 		 382 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  25.22 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  25.94 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  27.78 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  25.22 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  28.4 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  25.58 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  27.45 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  23.65 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  27.57 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  28.32 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  24.35 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  25.51 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  25.5 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  25.51 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  25.51 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  25.51 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  25.51 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  28.14 
 
 		 356 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  29.25 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  23.54 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  24.05 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  24.05 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  26.67 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  25.22 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  24.05 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  27.43 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  25.36 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  30.81 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  30.9 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  28.36 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  26.61 
 
 		 385 aa  79.3  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  24.71 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  25 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  25.21 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  30.31 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  24.27 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2960  galactokinase  27.71 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0133618  decreased coverage  0.000169773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  26.61 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  25.52 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  24.58 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  23.74 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  23.91 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  24.1 
 
 		 387 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  27.66 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  24.14 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  25.88 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  23.14 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  25.86 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  29.46 
 
 		 408 aa  72.8  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  26.15 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  24.3 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  27.24 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>