92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1385 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  49.5 
 
 
310 aa  311  1e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  43.23 
 
 
316 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  36.51 
 
 
306 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  38.28 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  38.82 
 
 
292 aa  195  9e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  36.13 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  36.13 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  33.11 
 
 
322 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  34.85 
 
 
306 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  35.4 
 
 
400 aa  150  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  33.44 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  35.97 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  32.57 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  33.22 
 
 
314 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  28.26 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  29.33 
 
 
316 aa  99  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  29.51 
 
 
290 aa  96.7  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  32.5 
 
 
322 aa  92.4  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  30.09 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  28.48 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  29.53 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.86 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.06 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  29.65 
 
 
338 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  30.32 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  28 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  30.67 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  29.89 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  27.19 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  25.71 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.7 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  27.78 
 
 
309 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.84 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  29.97 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  24.12 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  26.42 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  25.53 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  25.08 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  27.88 
 
 
336 aa  63.9  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  22.82 
 
 
349 aa  62.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25.95 
 
 
349 aa  62.4  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  25.29 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  26.5 
 
 
735 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25.27 
 
 
319 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  23.91 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  25.2 
 
 
356 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  25.56 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  23.91 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  23.16 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  24.49 
 
 
900 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  26.5 
 
 
369 aa  56.2  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  23.72 
 
 
389 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  24.66 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  27.27 
 
 
355 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.54 
 
 
359 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  25.41 
 
 
314 aa  54.3  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.22 
 
 
349 aa  53.1  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.51 
 
 
348 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  23.23 
 
 
372 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  48.21 
 
 
351 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  23.14 
 
 
361 aa  52.8  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  27.37 
 
 
490 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  23.62 
 
 
340 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  27.94 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  23.3 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  33.33 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31076  predicted protein  38.16 
 
 
488 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2211  galactokinase  34.48 
 
 
414 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.173587  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  30.97 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  26.43 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  23.21 
 
 
315 aa  47  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  23.78 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  32.47 
 
 
363 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  32.95 
 
 
387 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  29.52 
 
 
385 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3973  galactokinase  21.66 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.340727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  22.88 
 
 
395 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  23.55 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0973  galactokinase  28.43 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  26.52 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  38.46 
 
 
389 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  33.33 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  40.68 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  24.05 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  31.76 
 
 
399 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  30.85 
 
 
396 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  32.18 
 
 
387 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  30.19 
 
 
403 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  35.44 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  23.08 
 
 
432 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>