111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1124 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  100 
 
 
276 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  36.49 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  34.11 
 
 
310 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  34.74 
 
 
292 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  33.99 
 
 
316 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  34.11 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  34.22 
 
 
322 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  34.45 
 
 
306 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  28 
 
 
310 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.51 
 
 
306 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.51 
 
 
306 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.2 
 
 
316 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  29.97 
 
 
314 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  34.27 
 
 
322 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  26.33 
 
 
313 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  27.63 
 
 
314 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  30.82 
 
 
313 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  29.69 
 
 
290 aa  102  6e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  34.42 
 
 
309 aa  102  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  26.17 
 
 
321 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  29.41 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  30.83 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  30.4 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  31.05 
 
 
297 aa  84  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  33.08 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  26.04 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  28.52 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  26.92 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.88 
 
 
361 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  26.6 
 
 
327 aa  68.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  24.82 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  25 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  25 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  25.31 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  31.84 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  25.82 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  23.45 
 
 
328 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  25.66 
 
 
900 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.48 
 
 
432 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  22.98 
 
 
356 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  23.71 
 
 
349 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  24.84 
 
 
330 aa  59.3  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  28.48 
 
 
355 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  26.6 
 
 
336 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  23.48 
 
 
735 aa  56.2  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  24.05 
 
 
314 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  25.71 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25.42 
 
 
391 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  29.2 
 
 
351 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  23.7 
 
 
338 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  22.14 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  23.7 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  24.79 
 
 
403 aa  52.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  23.7 
 
 
359 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  21.77 
 
 
293 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82625  galactokinase  40 
 
 
518 aa  50.8  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560809  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  31 
 
 
289 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  23.38 
 
 
382 aa  49.7  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  28.1 
 
 
386 aa  49.7  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  42.25 
 
 
387 aa  49.3  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  25.93 
 
 
414 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  26.37 
 
 
328 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  23.08 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  24.05 
 
 
386 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  37.68 
 
 
394 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1387  mevalonate kinase-like protein  24.14 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.470504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.2 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  31.52 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  24.89 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  23.91 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  26.89 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  33.85 
 
 
405 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  19.31 
 
 
349 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  23.83 
 
 
357 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  22.69 
 
 
382 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  22.69 
 
 
382 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  22.69 
 
 
382 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  22.69 
 
 
382 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  37.31 
 
 
404 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  29.33 
 
 
392 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04957  galactokinase (AFU_orthologue; AFUA_3G10300)  30.77 
 
 
524 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0502  galactokinase  25 
 
 
384 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.592539  normal  0.852074 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  22.69 
 
 
382 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  33.33 
 
 
396 aa  45.8  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  21.13 
 
 
382 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  22.5 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  38.1 
 
 
390 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.55 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  22.5 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  22.5 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  22.53 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  22.5 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_3369  galactokinase  33.8 
 
 
397 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.949069  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  39.68 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  25.43 
 
 
388 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  28.41 
 
 
384 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04600  mevalonate kinase  28.14 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.797407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  34.33 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  22.07 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  21.86 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>