84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0238 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  78.1 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  78.1 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  36.81 
 
 		 310 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  36.36 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  34.85 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  34.31 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  34.45 
 
 		 276 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  33.89 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  32.21 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  32.55 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  31.13 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  29.69 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  28.66 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  30 
 
 		 400 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  28.34 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  30.77 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  28.67 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  27.53 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  27.03 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  26.6 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  26.78 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  26.91 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  24.92 
 
 		 327 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  26.13 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  27.03 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  25.25 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  25.17 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  27.46 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  26.77 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  23.59 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  26.81 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  25.17 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  26.81 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  28.17 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  27.51 
 
 		 321 aa  67  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  23.4 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  23.93 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  27.96 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  28.08 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  29.04 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  25.39 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  27.64 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  27.39 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  26.62 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.04 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  22.93 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  24.91 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.28 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  25.82 
 
 		 735 aa  55.8  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  24.28 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  29.08 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  22.61 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  22.29 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  28.48 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  25.57 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  23.51 
 
 		 339 aa  53.1  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  27.11 
 
 		 900 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.62 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  25.11 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  24.68 
 
 		 357 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  33.33 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  38.89 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  28.97 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  33.33 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  26.88 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  33.33 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  33.33 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0720  GHMP kinase  23.94 
 
 		 341 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  22.87 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  38.89 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  23.81 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  26.04 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  45.1 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  23.02 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  22.89 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  25.6 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  23.18 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  32.53 
 
 		 323 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  37.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  27.52 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  27.5 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  37.74 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1742  GHMP kinase  23.17 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.2795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>