More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0807 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  100 
 
 
309 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  100 
 
 
309 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  100 
 
 
309 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  88.35 
 
 
309 aa  577  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  83.5 
 
 
309 aa  551  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  82.85 
 
 
309 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  83.5 
 
 
309 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  81.55 
 
 
309 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  76.7 
 
 
309 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  76.7 
 
 
309 aa  510  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  77.02 
 
 
309 aa  511  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  76.7 
 
 
309 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  76.7 
 
 
309 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  76.7 
 
 
309 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  76.62 
 
 
310 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  76.3 
 
 
310 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  76.3 
 
 
310 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  69.01 
 
 
323 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  70.93 
 
 
318 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  68.69 
 
 
323 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  65.81 
 
 
318 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  61.98 
 
 
314 aa  412  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  59.42 
 
 
318 aa  367  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  53.99 
 
 
331 aa  338  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  54.84 
 
 
315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  52.87 
 
 
328 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  52.27 
 
 
311 aa  331  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  52.29 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  54.4 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  52.94 
 
 
319 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  52.7 
 
 
320 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  52.7 
 
 
320 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  52.7 
 
 
320 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  54.07 
 
 
312 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  52.38 
 
 
320 aa  324  9e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  53.75 
 
 
312 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  52.43 
 
 
314 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  54.4 
 
 
312 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  51.58 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  52.29 
 
 
316 aa  318  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  50 
 
 
328 aa  317  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  50.98 
 
 
311 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  36.52 
 
 
309 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  35.93 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  33.54 
 
 
305 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  32.91 
 
 
305 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  34.92 
 
 
309 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  31.63 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  35.74 
 
 
311 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  32.51 
 
 
306 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  31.32 
 
 
305 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  33.54 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  35.04 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  34.16 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  35 
 
 
320 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  32.14 
 
 
308 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  33.23 
 
 
320 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  34.19 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  33.85 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  35.02 
 
 
315 aa  132  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.58 
 
 
302 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  34.66 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  33.33 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1080  homoserine kinase  30.34 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129806 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  34.15 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  33.8 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  30.61 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  32.8 
 
 
325 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5245  homoserine kinase  30.03 
 
 
304 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  33.33 
 
 
316 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2698  homoserine kinase  27.87 
 
 
300 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0218075  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  31.21 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.22 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  30.1 
 
 
315 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.58 
 
 
315 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  32.29 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  31 
 
 
291 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  30.77 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  33.46 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  28.12 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  29.64 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  30.91 
 
 
296 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  31.27 
 
 
303 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  29.14 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  32.46 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  32.46 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  33.09 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  28.52 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.35 
 
 
300 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  30.38 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  25.08 
 
 
307 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1240  homoserine kinase  30.82 
 
 
314 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000301538  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  34.07 
 
 
304 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0899  homoserine kinase  29.21 
 
 
306 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>