200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1736 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  100 
 
 		 316 aa  621  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  80.19 
 
 		 314 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  60.65 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  48.7 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  32.23 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  39.61 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  32.57 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  29.77 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  36.27 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  28.37 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  31.21 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  32.4 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  32.24 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  28.32 
 
 		 276 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  34.4 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  33.11 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  35.37 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  31.93 
 
 		 290 aa  116  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3409  mevalonate kinase  36.21 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.147326  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  31.68 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  35.5 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  30.84 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  30.84 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  28.34 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  34.14 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  32.03 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  32.17 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  30.58 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  33.88 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  32.21 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  28.35 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  27.86 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  31.71 
 
 		 400 aa  93.2  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  27.42 
 
 		 735 aa  92  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  29.28 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  31.47 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  24.3 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.12 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  30.77 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.12 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  24.56 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  26.67 
 
 		 900 aa  82.8  0.000000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  25.27 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  30.79 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.69 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  25.17 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  29.03 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  27.76 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  24.65 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  33.33 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  26.19 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.39 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  22.65 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  27.43 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  22.65 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  28.24 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  25.85 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  25.43 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.63 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  23.62 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  27.72 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  29.8 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  26.84 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  24.34 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  25.54 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  24.74 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  25.87 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  26.59 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10631  galactokinase  27.36 
 
 		 363 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00193784  normal  0.94952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  28.32 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  24.36 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  26.12 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  26.85 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  25.44 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  27.48 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  26.72 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  27.02 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  29.01 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  27.76 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  25.31 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  22.74 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.15 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.33 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4183  GHMP kinase  26.89 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  24.18 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  23.3 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  23.05 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  22.51 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  23.3 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  25.23 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  23.46 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  23.02 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  21.89 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  22.67 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  29.79 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  27.04 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  27.41 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.51 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.51 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  28.63 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>