34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2303 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  40.56 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0654  GHMP kinase  45.32 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2435  GHMP kinase  40.62 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4780  GHMP kinase  40.29 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3721  GHMP kinase  44.12 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2154  putative kinase  32.59 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2018  GHMP kinase ATP-binding subunit  33.8 
 
 		 298 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1998  GHMP kinase ATP-binding subunit  33.8 
 
 		 294 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4497  GHMP kinase  33.71 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  33.82 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1969  kinase, putative  34.91 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3190  putative kinase  34.27 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1622  kinase, putative  34.27 
 
 		 323 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1398  putative kinase  34.27 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2124  putative kinase  34.27 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.206438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2562  GHMP kinase domain-containing protein  34.27 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0349401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2509  GHMP kinases putative ATP-binding protein  34.27 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2648  kinase  34.27 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1103  GHMP kinase  37.59 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1308  GHMP kinase  33.51 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0392  hypothetical protein  33.7 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0788  hypothetical protein  32.28 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.796268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2444  hypothetical protein  30.98 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0102823  normal  0.0183813 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0066  GHMP kinase  28.32 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  27.51 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0942  GHMP kinase  23.92 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.977974  normal  0.388216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2181  propanediol utilization  28.5 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  26.92 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2281  propanediol utilization protein  27.98 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2228  propanediol utilization  27.98 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.484991  normal  0.20213 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  24.42 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  23.19 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  25 
 
 		 314 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>