29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1998 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2154  putative kinase  100 
 
 
329 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1998  GHMP kinase ATP-binding subunit  100 
 
 
294 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2018  GHMP kinase ATP-binding subunit  99.32 
 
 
298 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4497  GHMP kinase  41.37 
 
 
334 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1622  kinase, putative  38.75 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2648  kinase  38.75 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1398  putative kinase  38.75 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2124  putative kinase  38.75 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.206438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3190  putative kinase  38.75 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2509  GHMP kinases putative ATP-binding protein  38.75 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2562  GHMP kinase domain-containing protein  38.75 
 
 
399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0349401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1969  kinase, putative  38.52 
 
 
396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  31.8 
 
 
328 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0654  GHMP kinase  32.32 
 
 
325 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1103  GHMP kinase  32.66 
 
 
303 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  33.33 
 
 
337 aa  98.2  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  29.51 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1308  GHMP kinase  29.08 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2435  GHMP kinase  32.46 
 
 
332 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4780  GHMP kinase  30.74 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0942  GHMP kinase  23.84 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.977974  normal  0.388216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2181  propanediol utilization  26.05 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2235  propanediol utilization  25.67 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0066  GHMP kinase  26.72 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2228  propanediol utilization  25.67 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.484991  normal  0.20213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2281  propanediol utilization protein  26.05 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0102974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2394  propanediol utilization  25.67 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3721  GHMP kinase  30.08 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0133  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.39 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00187677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>