27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2394 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2394  propanediol utilization  100 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2235  propanediol utilization  99.65 
 
 		 288 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2228  propanediol utilization  99.31 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.484991  normal  0.20213 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2281  propanediol utilization protein  99.31 
 
 		 288 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2181  propanediol utilization  98.96 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  32.29 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1103  GHMP kinase  32.41 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0066  GHMP kinase  30.56 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4497  GHMP kinase  27.82 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1308  GHMP kinase  26.02 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0942  GHMP kinase  22.84 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.977974  normal  0.388216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0654  GHMP kinase  35.87 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1998  GHMP kinase ATP-binding subunit  25.67 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2154  putative kinase  25.67 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2018  GHMP kinase ATP-binding subunit  25.29 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  32.6 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1622  kinase, putative  25.83 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1398  putative kinase  25.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2562  GHMP kinase domain-containing protein  25.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0349401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2509  GHMP kinases putative ATP-binding protein  25.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3190  putative kinase  25.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2124  putative kinase  25.83 
 
 		 399 aa  67  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.206438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2648  kinase  25.83 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1969  kinase, putative  26.57 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4780  GHMP kinase  28.65 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  25.84 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3721  GHMP kinase  31.22 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>