28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4497 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4497  GHMP kinase  100 
 
 		 334 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2648  kinase  41.34 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1622  kinase, putative  41.34 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2124  putative kinase  41.34 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.206438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3190  putative kinase  41.34 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2509  GHMP kinases putative ATP-binding protein  41.34 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2562  GHMP kinase domain-containing protein  41.34 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0349401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1398  putative kinase  41.34 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2154  putative kinase  40.86 
 
 		 329 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1969  kinase, putative  40.94 
 
 		 396 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1998  GHMP kinase ATP-binding subunit  40.86 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2018  GHMP kinase ATP-binding subunit  40.08 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  34.38 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  34.08 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1103  GHMP kinase  37.01 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0654  GHMP kinase  31.58 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1308  GHMP kinase  29 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2435  GHMP kinase  30.23 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  30.6 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2281  propanediol utilization protein  28.68 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0102974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2228  propanediol utilization  28.01 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.484991  normal  0.20213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2181  propanediol utilization  28.01 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2235  propanediol utilization  27.99 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2394  propanediol utilization  27.99 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3721  GHMP kinase  35.69 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0942  GHMP kinase  25.59 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.977974  normal  0.388216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4780  GHMP kinase  33.7 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0066  GHMP kinase  28.14 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>