24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2435 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2435  GHMP kinase  100 
 
 
332 aa  666    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0654  GHMP kinase  40.27 
 
 
325 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7478  GHMP kinase  38.06 
 
 
328 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4780  GHMP kinase  43.01 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2303  hypothetical protein  40.62 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.514488  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1622  kinase, putative  33.68 
 
 
323 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2562  GHMP kinase domain-containing protein  33.68 
 
 
399 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0349401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3190  putative kinase  33.68 
 
 
399 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2124  putative kinase  33.68 
 
 
399 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.206438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2509  GHMP kinases putative ATP-binding protein  33.68 
 
 
399 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2648  kinase  33.68 
 
 
347 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1969  kinase, putative  32.78 
 
 
396 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1398  putative kinase  33.68 
 
 
399 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3721  GHMP kinase  39.34 
 
 
303 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2154  putative kinase  31.69 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.200928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1998  GHMP kinase ATP-binding subunit  32.46 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2018  GHMP kinase ATP-binding subunit  31.41 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4497  GHMP kinase  29.97 
 
 
334 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1308  GHMP kinase  32.77 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1103  GHMP kinase  32.21 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0066  GHMP kinase  29.76 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2702  GHMP kinase  28.44 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0392  hypothetical protein  34.15 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375358  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0788  hypothetical protein  31.03 
 
 
277 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.796268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>