12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4183 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4183  GHMP kinase  100 
 
 		 347 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4626  GHMP kinase  68.58 
 
 		 331 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40817  predicted protein  37.07 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  23.81 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  26.47 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  23.59 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  25.69 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  25.67 
 
 		 314 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4922  GHMP kinase  25.44 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  21.93 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  21.9 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  26.91 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>