88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1599 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  68.4 
 
 
314 aa  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  68.51 
 
 
314 aa  426  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  64.61 
 
 
310 aa  391  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  41.73 
 
 
336 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  36.19 
 
 
316 aa  139  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  34.19 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  36 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  32.66 
 
 
314 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  32.19 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  33.46 
 
 
301 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  34.75 
 
 
328 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  35.64 
 
 
338 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  32.48 
 
 
321 aa  103  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  35.03 
 
 
330 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  35.88 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.9 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  31.87 
 
 
356 aa  93.2  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  28.14 
 
 
317 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  32.09 
 
 
322 aa  90.1  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  30.82 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  30.82 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  33.33 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  28.14 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  28.81 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  28.01 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  29.03 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  30.66 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  27.3 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  27.12 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  25.5 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  24.21 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  26.57 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  27.7 
 
 
276 aa  68.9  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  31.4 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  24.83 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  22.7 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  22.7 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  26.85 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  26.85 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.32 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  29.33 
 
 
289 aa  60.1  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  26.19 
 
 
359 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  24.25 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1732  GHMP kinase  23.08 
 
 
349 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  25.84 
 
 
355 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0708  mevalonate kinase  23.13 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  25.45 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  32.18 
 
 
289 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  25.7 
 
 
432 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  25.48 
 
 
314 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  28.74 
 
 
382 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  22.67 
 
 
403 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  25.22 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.34 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  28.35 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3115  GHMP kinase  24.27 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  23.27 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  23.27 
 
 
350 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  28.64 
 
 
354 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  25.68 
 
 
286 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2017  hypothetical protein  24.32 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2022  hypothetical protein  24.77 
 
 
293 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  25.52 
 
 
390 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  24.54 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  24.24 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  26.09 
 
 
349 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  23.16 
 
 
387 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  26.45 
 
 
322 aa  47  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  23.21 
 
 
310 aa  47  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  23.43 
 
 
387 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  24.59 
 
 
735 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0214  GHMP kinase  21.59 
 
 
355 aa  45.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0700927  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  25.84 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  24.01 
 
 
900 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  24.31 
 
 
392 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  23.71 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  23.55 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  24.16 
 
 
389 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  23.43 
 
 
392 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  26.4 
 
 
399 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  22.84 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  28.35 
 
 
383 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  23.65 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0312  mevalonate kinase  25 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0669992 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  23.4 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  76 
 
 
490 aa  42.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0238  mevalonate kinase  24.44 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>